根据
农业部（1991）农（质）字第60号文件，中国水稻研究所以谷物化学及加工系和植保系农药研究室为基础组建了“农业部稻米及制品质量监督检验
测试中心”，于1997年9月通过农业部组织的国家计量认证和机构认可首次评审，2007年9月通过复查评审。2001年
浙江省以浙编[2001]69号文件批准建立了“浙江大地农作物产品质量安全检测中心”，并明确与“中心”合署，实行两个机构，一套人员的工作体制，2002年9月20日通过浙江省质量技术监督局组织的计量认证，2007年9月通过复查评审。
中心现有员工37名，涵盖了农残检测、食品安全、化学、发酵、农学、食品、经济等方面专业人才，其中高级职称11名，中级职称9名，技术人员比例达100%。中心拥有农业部相关部门专家委员会成员3名，国家级实验室资质认定评审员4名，浙江省计量认证评审员2名，国家有机认证注册高级检查员4名；博士2名。拥有仪器设备118台（套），其中50万元以上9台（套），固定资产3000万元，建立了以
质谱检测为基础的高精度、国际先进的检测技术平台，并具备未知物鉴定的能力。实验室总面积1800平方米，全部由中央空调系统调控，实行电子化管理。
中心在发展中坚持“以质检树权威、以研究强基础、以服务增效率、以创新促发展”，按“科技研究型、快速反应型、国际接轨型”质检机构的目标加强自身建设，形成稻米品质检测精深、农作物产品质量安全检测面广的检测业务能力。中心按照“全国农产品质量安全检验检测体系规划”对部级专业质检中心的功能定位积极开展工作：年承担检测样品超过1万份，包括国家、省、市三级的农产品质量安全指令性检测任务，“无公害、绿色、有机食品、农产品地理标志”等“三品一标”认证检测，植物源性农产品出口检测，稻米品质鉴定，以及其他委托检验；开展农产品质量安全风险分析与评估工作，科学归纳总结检测数据，为各级农业行政主管部门提供相关产品质量安全分析报告；在稻米品质、生产过程控制、农药残留等方面颁布国家、行业和地方标准总计45项；负责稻米国内外质量安全对比分析研究和国内外合作与交流；开展有关专业农产品质量安全方面的技术咨询和技术服务，指导企业建立稻米“三品一标”标准化生产基地，为地方质检中心、企业的专业人员等进行技术培训。
作为中国水稻研究所的质量标准与检测技术创新团队，积极推进植物活性物质和食味品质两个特色实验室建设，2007-2009年在研课题15项，在稻米污染物、农残检测技术、稻米品质等方面取得多项成果，出版著作3册，发表文章68篇，其中SCI论文8篇；“谷物、果蔬中农药多残留高通量检测技术平台的建立与应用”获2011年中国农业科学院科技成果二等奖。