20世纪80年代以来，农村
金融市场论或农村金融系统论(Rural Financial Systems Paradigm)逐渐替代了
农业信贷补贴论。农村
金融市场论是在对
农业信贷补贴论批判的基础上产生的，强调
市场机制的作用，其主要理论前提与农业信贷补贴论完全相反：
(1)农村居民以及贫困阶层是有
储蓄能力的。对各类
发展中国家的农村地区的研究表明，只要提供存款的机会，即使贫困地区的小农户也可以
储蓄相当大数量的存款，故没有必要由外部向农村注入资金。
农村
金融市场论完全依赖
市场机制，极力反对
政策性金融对市场的扭曲，特别强调利率的
市场化。该理论认为，利息补贴应对补贴信贷活动的一系列缺陷负责，而
利率自由化可以使农村
金融中介机构能够补偿其
经营成本。这样就可以要求它们像金融实体那样运行，承担适当的利润限额；
利率自由化也可以鼓励
金融中介机构有效地动员农村
储蓄，这将使它们更加不依赖于外部的资金来源，同时使它们有责任去管理自己的资金。
农村
金融市场论虽然替代了
农业信贷补贴论，但它的功效或许并没有想象中的那么大。例如，通过
利率自由化能否使小农户充分地得到正式
金融市场的
贷款，仍然是一个问题。自由化的利率可能会减少对
信贷的
总需求，从而可以在一定程度上改善小农户获得资金的状况，但高成本和缺少
担保品，可能仍会使它们不能借到所期望的那么多的资金，所以，仍然需要政府的介入以照顾小农户的利益。在一定的情况下，如果有适当的体制结构来管理
信贷计划的话，对
发展中国家农村
金融市场的介入仍然是有道理的。
对于农村
金融市场论，农村金融改革是十分重要的：（1）农村内部的
金融中介在农村金融中发挥重要作用，
储蓄动员是关键；（2）为实现储蓄动员、平衡资金供求，利率必须由市场决定。实际
存款利率不能为负数；（3）农村金融成功与否，应根据
金融机构的成果（资金中介额）与经营的自立性和持续性来判断；（4）没有必要实行为特定利益集团服务的目标
贷款制度；（5）非正规金融具有合理性，不应无理取消。应当将正规
金融市场与非正规金融市场结合起来。