它有四个主要分支机构,学校坐落在日本南部。位于孤岛,学生会依照所属学院而穿着红色、黄色或蓝色的夹克。有四个宿舍建筑,学生被对应分成三个等级,低端决斗者在红色的宿舍,在黄色宿舍决斗者的中间立场,排名靠前的决斗者的蓝宿舍(蓝色是唯一的宿舍是分为两个建筑,一个男生和一个女生)。
学生根据入学考试成绩排名,参加高等考试,成绩好的进入黄宿舍,差生分入红宿舍。成绩优秀的中等生升学才可以直接进入蓝宿舍。每个学生的决斗盘、校服都与决斗者的宿舍颜色相匹配。四个宿舍建筑房子的学生被分成等级,低端决斗者在奥西里斯(天空龙)红色的宿舍,在
拉(
翼神龙)黄色宿舍决斗者的中间立场,排名靠前的决斗者的方尖塔(巨神兵)蓝宿舍。
方尖碑白色时存在的临时宿舍。
斎王琢磨携带破灭之光入侵决斗学院。十代失踪之后,由于可以看到决斗怪兽的精灵之类的原因,
万丈目准被由破灭之光控制的斋王洗脑,进入光之结社,自称变成了“万丈目白色闪电”,把学院中一大半的学生拉进光之结社(从某种意义上来说这也可以看出万丈目的实力其实很强),为斋王服务。之后万丈目成功打败
天上院明日香,将明日香同化成光之结社的一员。女主角明日香被洗脑后成为反派,并被斋王培养成光之结社的女性干部,与万丈目一同直接为斋王服务,像仆人一般跟随在斋王身边。斋王试图将
游城十代也拉入光之结社,但多次尝试均失败。万丈目与十代战斗之后,回想起之前的事情,终于恢复了正常,但对在光之结社期间的事完全没有记忆,不久之后带领学院中的其他学生全歼光之结社的成员,在打败
早乙女礼之后,获得GX大赛的冠军。明日香最终被破灭之光控制的斋王彻底洗脑成没有意识的仆从,在被十代打败后,意识被唤醒,恢复了正常。最终斋王被十代打败,光之结社消失。返校后的鲛岛校长允许这个宿舍成为官员。白宿舍服装类似于方尖碑蓝色制服的男性和女性,唯一的区别是颜色的改变从皇家蓝白相间设计白色和淡紫色的设计。