《凤凰四重奏》主要写中国四代女人不同的婚姻故事，第一代以清末年间一段
盲婚哑嫁婚姻作为故事之序幕。女主角魏瑜凤是个知书识礼、外柔内刚、性格坚毅的千金小姐。她与家中的厨师余赐有段青梅竹马的感情，可惜因为家道中落，被逼嫁给太史公的儿子汪毓麟，瑜凤被逼为了一段政治婚姻放弃一段大好姻缘。可惜，汪毓麟是个挥霍无道又烂赌的二世祖，很快就把全部家产败光，且激死了太史公。这时候，余赐已经拜前御膳太监为师，学有所成，余赐希望带瑜凤离开太史府过新生活，但瑜凤不忍心见太史府家散人亡，于是变卖了余赐送给自己的凤凰玉筷子，开设了一间细小的食肆“凤凰楼”，且打动余赐出任大厨，希望替毓麟重振家声。“凤凰楼”在瑜凤和余赐的悉心打理下，生意蒸蒸日上，远近驰名。但毓麟却依然故我，就算是在瑜凤临盘那晚，仍在外面花天酒地。瑜凤由始至终对毓麟都没有感情，不过，亦没有跟余赐有任何越轨的行为，他们之间存在的是友情亦是精神上的爱情，1905年，余赐送瑜凤南下办货途中，遇火车出轨，余赐见状立刻前往，不幸却在两人旁边爆炸，两个人生前不能够结合，死后留下一间共同开创的“凤凰楼”，纪念一段未有开花结果的感情。
第二代女主角汪子君是“凤凰楼”创办人瑜凤之女，是个性格佻皮活泼的高中女生，暗恋一个热血青年教师
李吉祥，可惜李吉祥已经有个盲婚哑嫁但未过门的妻子，子君不想步母亲后尘抱憾终身，于是主动争取，终于打动吉祥，两个人为了爱情双双私奔到天津过二人世界的生活。可惜，贫贱夫妻百事哀，激情过后，两夫妻开始因为柴米油盐等生活锁事而产生摩擦，加上种种误会，在一时意气之下分手，一个重投革命事业，一个回老家打理家族事业。但可惜子君已经迟了一步，“凤凰楼”因为经营不善被逼要卖盘易手，子君拿着母亲留下的食谱悔不当初。就在她最失意的时候重遇吉祥，两人发现其实心底里仍是深爱对方，短聚缠绵过后，吉祥要为革命事业再次上路，子君答应吉祥会好好生活下去。之后，子君生了一个女儿，也很努力读书，成为北大第一个女生。但是吉祥就一去不返，子君一直不肯安神主牌，且跟女儿讲：爸爸始终有一日会回来！乱世儿女，生离死别，在中国苦难的年代纵然相爱但是不知有没有明天，也不知道何时才等到明天！
第三代的女主角
白慧珍是第二代主角子君的外孙女。慧珍是个精明能干，充满活力的女人，不过其丈夫
戴立仁偏偏就是个爱面子的大男人，立仁认为“男主外，女主内”，所以婚后不让妻子出来工作。故事讲述慧珍如何在机缘巧合下瞒着丈夫在外面一间公关公司工作。后来却让立仁发现，但阴差阳错，慧珍成了立仁的上司。慧珍家庭事业两兼顾，无理取闹的立仁便带领一班老婆奴的兄弟走私偷情，以宣示大男人的尊严。最后给太太团捉奸成功，那班男人个个投降，只有立仁声大夹恶，慧珍忍无可忍之下决定离婚。就在此时，慧珍和立仁被公司派去接手做一个宣传“凤凰楼”的project，原来由北京移师来香港经营的“凤凰楼”正面临结业危机。“凤凰楼”是慧珍太婆所开创的，期间易手。而慧珍跟立仁当年在暴动的时候一同冲入“凤凰楼”躲避而结缘，所以慧珍对“凤凰楼”特别有感情，为了挽救“凤凰楼”，两夫妻有机会重温旧梦，亦令彼此认识更深。最后凤凰楼逃不过结业的命运，但两夫妻却因而重修旧好。
第四代的女主角戴思嘉是第三代主角白慧珍的女儿。女主角
戴思嘉是个啤酒妹，性格独立自我，感情生活开放但是有底线，同时下大部分年青人一样，思嘉对婚姻抗拒，至于男主角方家安，就是个要求严谨的会计师，做事按部就班有计划，两个性格南辕北辙的人邂逅相恋，接着同居。因为大家对婚姻有不同理解同期望，结果和平分手。家安也调往上海。分手之后的思嘉，人成熟了，拿出曾太婆流传下来的食谱秘密练兵，四处找人投资重开“凤凰楼”。期间遇上一些挑战，幸好得家安暗中帮忙，“凤凰楼”的金漆招牌才可以保得住。就此时，思嘉意外怀了家安的骨肉。家安得知后，希望重归就好，思嘉认为没有理由为了个婴儿而勉强结婚，于是一个做婴儿的爸爸，一个做婴儿的妈妈。大家不是夫妻而是partner的身份，一齐合力抚养婴儿，亦因为这个婴儿，两个人多了共同的理念。2006年的春节，家安突然间向思嘉求婚。
由于故事由食店《凤凰楼》开始，又贯穿四代人的生活，所以叫做“凤凰四重奏”。充满传奇色彩的食肆“凤凰楼”是剧中《四重奏》的百年家业，“凤凰楼”诞生于乱世，湮没于盛世，继而重生于香港。当中兴衰更迭的发展过程，正标志着四代女子以血汗所铭刻的，一个属于女人的家族历史。
从清末封建家庭中恪守妇道的坚忍媳妇，至五四时期奢言恋爱自由，私奔出走的新女性；从六七十年代香港经济起飞下打破“男主外，女主内”的职业妇女，至廿一世纪新世代中感情轻不着地的无根女子——藉着四个互有牵连但各自独立的故事，连同当中众多的副线人物如童养媳、自梳女、冥婚妇人、交际花、马姐、离婚妇人等等，建构出一幅幅充满不同时代色彩的妇女图像。
该剧除了审视百年以来的婚姻状态与女性地位外，也反思了人们如何在婚姻制度中备受挑战、男女感情聚散容易的今天。（腾讯娱乐 评）除审视百年以来的婚姻与女性历史外，又反思人们如何在婚姻制度备受挑战、男女感情聚散容易的今天，重拾爱护、欣赏、包容他人的美好质性。（TVB 评）
和一般港产剧追求轻松、快餐式的娱乐不同，该剧犹如一部“电视版的文艺影片”，剧情更与章子怡一人分饰多角的影片《茉莉花开》异曲同工，通过刻画四个不同年代的女子，在不同的时空与文化环境下，奏出的四段缠绵感人的恋爱乐章，透视近百年间女性的婚姻与爱情及其地位的变化。（武汉晨报 评）