《分子影像学杂志》创刊于1977年，是由广东省教育厅主管、南方医科大学主办的期刊。

1977年，《医校学报》创刊。

1995年，该刊更名为《解放军广州医高专学报》，以半年刊形式发行。

1999年，该刊更名为《广州医高专学报》。

2000年，该刊更名为《第一军医大学分校学报》。

2014年，该刊以季刊发行；12月，该刊入选中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

2016年第4期起，由该刊出版，英文目次与文摘，版权页汉英对照。

2017年6月29日，《分子影像学杂志》升级版微信公众号正式上线。

2021年5月10日，经广东省新闻出版局审批（粤新出期刊审〔2021〕29号），同意《分子影像学杂志》刊期由季刊变更为双月刊；7月17日，《分子影像学杂志》正式启用新的采编系统，旧采编系统不再接收投稿。

《分子影像学杂志》的主要栏目有综述、述评、临床研究、基础研究、技术方法、调查报告、医疗卫生管理、医学教育、临床护理、基层园地、短篇及病例报道等。

《分子影像学杂志》主要反映中国国内外医疗、科研、教学、管理的新动向、新进展，报道中国国内外基础医学、临床医学、医学教育和管理等学科的研究成果及实践经验。

《分子影像学杂志》以各级医药卫生技术人员和管理人员为主要读者对象。

据2021年11月《分子影像学杂志》编辑部官网显示，《分子影像学杂志》编委会有委员81人。据2021年第5期《分子影像学杂志》期刊内页显示，《分子影像学杂志》编辑部有责任编辑1人、责任校对2人。

据2021年11月10日中国知网显示，《分子影像学杂志》共出版文献量为1167篇。

据2021年11月10日万方数据知识服务平台显示，《分子影像学杂志》共出版文献量为1148篇、基金论文量为520篇。

《分子影像学杂志》是中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊），被中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中国核心期刊（遴选）数据库、中国学术期刊（光盘版）、中国科技期刊引证报告、美国《乌利希期刊指南》（Ulrichsweb）、哥白尼索引等收录。

2020年12月29日，科技部中国科学技术信息研究所发布中国科技论文统计结果，该刊影响因子上升至0.97。

据2021年11月10日中国知网显示，《分子影像学杂志》总被下载次数为99275次、总被引次数为2445次；（2020版）复合影响因子为0.401、（2020版）综合影响因子为0.346。

据2021年11月10日万方数据知识服务平台显示，《分子影像学杂志》被引量为2555次、下载量为35147次；据2018年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊影响因子为0.75，在全部统计源期刊（6718种）中排第2446名。

《分子影像学杂志》的办刊宗旨：加强中国国内外分子影像学学术成果的传播与交流。

1、文题应恰当、简明地反映文章的主题，一般不宜超过20个汉字。

2、署名作者的人数和顺序由作者自定，在编排过程中原则上不应再变动，任何署名的改变要有全部作者签名同意的书面材料。作者单位包括工作单位全称及科室名称，另加城市名称及邮政编码，不同单位的作者在姓名右上角标示角标1, 2……并在其工作单位前相应标出1，2……。文后需附第一作者和通讯作者简介（学历、职称、电话、E-mail），并标注基金项目名称和编号，如“基金项目：中国国家自然科学基金（30271269）”。

3、论文需附中、英文摘要，摘要采用第三人称撰写，采用结构式摘要的形式，即包括目的、方法、结果及结论四部分。英文摘要应与中文摘要内容一致，英文摘要前应列出英文题名、所有作者姓名（如HU Dehui, ZENG Weisen）、单位名称（写到科室）等。