分离方法是把需要的物质从混合物分离出来的方法。该法的种类很多，可根据物质的物理和化学特性进行分类。分离方法广泛用于小分子和生物大分子混合物的分离纯化，是提纯物质不可缺少的手段。仅蛋白质混合物的分离方法就有多种。

仅蛋白质混合物的分离方法就有多种：①按照分子的大小进行分离，有透析法、超滤法、密度梯度离心法、凝胶过滤法。②利用溶解度差进行分离，有：利用等电点沉淀和pH的控制技术;利用蛋白质的盐溶和盐析技术;利用有机溶剂萃取分离法。③根据电荷的不同进行分离，有电泳法和离子交换法。④利用蛋白质的选择性吸附进行分离。⑤根据对配位基的生物学特异性进行分离，有亲合层析法。