功能改变（change of function）是指身体结构或行为模式的功能在演化过程中的变化。

经典的例子是从脊椎动物头盖骨的比较解剖中得到的，鱼类、两栖类、爬行类动物中形成颌骨关节的骨头，到了哺乳动物，就演化成中耳的锤骨和砧骨，成为听觉器官的重要部分；同时，颌骨关节的功能转由另外的骨成分，即鳞状骨和关节骨的二级颌骨关节承担。行为改变的例子是，乞食、造窝和其他行为成分演变成求偶行为。这是功能改变中表现最充分的，因为由其他行为演变而来的求偶展示行为通过仪式化，又可演化为适于交际功能的行为。