以为，针对育种中存在的主要问题及市场发展需要，充分发掘和利用地方品种遗传资源，立足于现代遗传学及育种技术的发展前沿，采用数量遗传学、分子生物学、计算机和系统工程等技术手段，实行多学科协同配合，重点开展优质、抗逆、抗病相关性状功能基因（或分子标记候选基因）研究、数量遗传学理论与育种规划的优化和优质高产畜禽新品种（配套系）选育，坚持理论与实践并重，为推动研究成果的产业化示范和生产应用奠定基础。

动物育种的数量遗传学理论与育种规划的优化

畜禽功能基因解析及其与重要经济性状的关联性

畜禽产量与品质性状的改良与新品种培育

经四川省科技厅批准启动

以猪鸡兔牛羊等畜禽品种为主要研究对象，针对育种中存在的主要问题及市场发展需要,充分发掘和利用地方品种遗传资源，立足于现代遗传学及育种技术的发展前沿，采用数量遗传学、分子生物学、计算机和系统工程等技术手段，实行多学科协同配合，重点开展优质、抗逆、抗病相关性状功能基因（或分子标记候选基因）研究、数量遗传学理论与育种规划的优化和优质高产畜禽新品种（配套系）选育，坚持理论与实践并重，为推动研究成果的产业化示范和生产应用奠定基础。

在优质高产畜禽新品种（配套系）培育及优质、抗逆、抗病相关性状功能基因研究方面取得国内领先的研究成果；积极推进常规技术与高新技术研究的有效结合，在优质畜禽品系培育关键技术取得突破，培育出具地方优势的新型优质、高效、抗病的畜禽新品系或配套系，进一步提高我省畜禽品种的市场竞争力，加强地方畜禽资源保护和利用；在畜禽数量遗传学理论与育种规划研究方面取得创新性成果；结合四川省畜禽育种攻关和生物技术产业工程实施计划，进一步加强实验条件与平台的建设；建立畜禽（以猪、鸡为主的）育种研究创新模式，提升实验室的研究实力，使四川动物遗传育种研究成为国内有显著特色和优势的重点学科。