北京大学—香港大学深港发展与创新研究中心依托北京大学和香港大学雄厚的师资力量和丰富的实证经验，以大珠江三角洲地区（包括港澳及珠三角）为主要研究对象，以区域发展和创新为研究内容，产学研紧密结合以培养高层次人才并为粤港澳三地政府提供决策依据。

中心主要研究领域包括城市与区域发展和创新、城市化及其生态环境效应、跨界（境）经济合作与跨政区空间治理等方面。研究中心在北大深研院和港大分别设立分中心，中心主任由双方派员轮值担任。研究中心现有教授3人、副教授/高级工程师2人、讲师1人、博士后4人、博士及硕士研究生20余人，并聘请了多位国内外知名学者担任兼职教授。