北京大学口腔医学研究所是位于北京的研究所，成立于1978年，隶属北京大学口腔医院（简称北大口腔）始建于1941年，从国立北京大学医学院附属医院的齿科诊疗室一步步发展壮大。
①口腔颌面组织缺损和畸形的外科矫治（如
先天性唇腭裂畸形、颌面软硬组织的发育畸形及各种外伤、肿瘤切除等后天因素造成的颜面与颌骨缺损）；
④口腔颌面部疾病的影像学诊断及其病理学基础（
颞下颌关节疾病的影像学、介入性放射学、涎腺疾病影像学及数字化成像技术等）；
⑤
牙齿缺失的集成化修复技术研究（如相关几何模型和数据库的建立、计算机辅助义齿设计和可切削陶瓷材料的研制等）。
③口腔颌面部疾病相关基因的研究（如与
侵袭性牙周炎发病相关的IL-1基因族、TNF基因族、FcrRIIA和IIIB基因多态性、Gm2及VDR基因等；无汗/少汗性
外胚层发育不良的疾病相关基因；痣样
基底细胞癌综合征的致病基因PTCH基因等）。