北京大学深圳研究生院环境与城市学院创建于2002年，为北京大学深圳研究生院六大基础办学单位之一。学院办学宗旨是“与北京大学本部相关学院进行互补性相对独立的错位办学，按照国际化水准的要求，着力培养高层次应用型专业技术人才”。
学院设有环境科学、
环境工程、地理学（城市与区域规划）和地理学（景观设计学）四个独立的硕士生招生专业，并依托本部城市与环境学院的自然地理学、
人文地理学和
环境科学与工程学院的环境科学、环境工程博士点，招收相关专业的博士研究生，同时利用本部城市与环境学院和环境科学与工程学院两个
博士后流动站，招收博士后研究人员。
环境与城市学院的业务构成中包括环境科学和地理学两个一级学科，其中环境科学重点针对现代社会经济可持续发展进程中不断涌现的各类环境和资源问题开展专项理论与技术研究，重点研究领域包括
生物能源技术、室内外大气污染规律及模拟、水环境综合整治与修复技术、农村环境污染控制策略、区域环境管理与政策、环境影响评价等。地理学部分则重点围绕现代城市化过程中的资源、生态和空间管控要求进行公共政策和技术研究，重点研究领域包括城市与区域规划、景观设计学、
城市生态规划、城市设计学、土地利用规划、数字城市技术、循环经济技术与政策等。
经过8年的持续建设，环境与城市学院具备了较为完善的科研基础设施和科研机构设置框架。由深圳市政府分别资助3000万元和200万元建设的城市
人居环境科学与技术重点实验室及
深圳市循环经济重点实验室均设置在本学院，使得学院具备了国际先进水准的教学科研技术装备和实验能力。学院已经成立了景观生态学与数字城市研究中心、深港联合发展研究中心和城市设计研究中心等科研机构，北京大学深圳研究生院的实体科研生产单位“北京大学（深圳）国土与城市规划设计研究院”亦挂靠在本学院，可以切实为有关专业研究生的科研实践能力培养提供便利条件。