北京干细胞与再生医学研究院（以下简称“北京干细胞研究院”）是由
中国科学院和
北京市人民政府合作共建的新型研发机构，于2020年4月正式登记成立，是具有独立法人资格的事业单位，举办单位为
北京市科学技术委员会。北京干细胞研究院实行理事会领导下的院长负责制，执行院长为胡宝洋研究员。
2019年10月18日，在2019中关村论坛重大成果发布会上，中国科学院与
北京市人民政府签署《共建北京干细胞与再生医学研究院框架协议》。
双方将按照“共同建设、共同管理、成果共享、整体规划、分步实施”的原则共建新型研发机构北京干细胞与再生医学研究院，共同讨论审定研究院的发展规划和建设方案，共同筹措落实建设和运行资源。
中科院副秘书长
周琪代表中科院签署协议。他指出，科技创新深刻影响社会发展和人民生活，人类面临的共同挑战也需要科技创新来应对。新型研发机构是科技创新的“试验田”，目标是让人、财、物流动起来，让优秀的、交叉的、融合汇聚的科研团队来做科技创新，让市场、资本来推动成果转移转化。他表示，有北京市“科创30条”利好政策，有中科院这支战略科技力量的不懈努力，在各方面的支持下，北京干细胞与再生医学研究院这片“试验田”一定能够结出累累硕果，引领干细胞与再生医学原始创新，促进研究成果转移转化，为建设北京全国科技创新中心及创新型国家做出重要贡献。
2020年4月，北京干细胞与再生医学研究院正式登记成立。9月22日，北京干细胞与再生医学研究院（以下简称“干细胞研究院”）建设工作推进会在京召开，标志着干细胞研究院建设工作全面启动。中科院副院长
相里斌，北京市副市长
隋振江，中科院副秘书长、干细胞研究院理事长
周琪，北京市科委主任
许强出席会议并共同为干细胞研究院揭牌。
北京干细胞研究院成立的宗旨：开展
干细胞与
再生医学研究，促进生命与健康科技发展。业务范围包括：（一）干细胞与再生医学研究、生命交叉前沿技术与装备研发；（二）相关成果转化与推广；（三）相关规范与标准研究；（四）相关国际交流合作；（五）相关人才培养。
北京干细胞研究院通过前瞻性科研布局，鲜明的多学科及大学科交叉，大胆的体制机制及运行模式等管理创新，积极推动与北京市政府、临床机构、企业等实现共建共治共享，探索新时期国立科研机构推动科技创新新模式。
未来，北京干细胞研究院将整合北京相关领域优质资源和人才优势，采取顶层设计、统一规划、协调推进、边建设边研究的发展策略，建成能够支撑干细胞与再生医学领域重大理论创新和技术突破的高水平平台。
干细胞研究院已申请发明专利44件，高价值发明专利率达到43%（共19件），其中4件专利已获得授权。基于自主知识产权技术开展的临床研究项目3项，其中1项已启动并进入受试者入组阶段。
干细胞研究院凝聚了一批干细胞与再生医学领域的优势人才。目 前该北京干细胞与再生医学研究院拥有一支约100人规模的人才队伍，其中双聘科研人员约70人，共有30余个高水平科研团队；全职管理支撑人员约30人，包括了科研、临床项目、知识产权、成果转化、法务、资源与标准等多元化人才，已初步形成了从基础研究到成果转化的全链条人才梯队。为加强自主人才培养，干细胞研究院于2021年启动了“致一研究员”计划，已遴选和支持7名优秀青年人才。