北京怀柔综合性国家科学中心是2017年5月获批，中心重点工作聚焦于系统推进重点科学领域跨越发展，推进国家重大科技基础设施集群发展，科学布局前沿交叉研究平台等方面，到2020年，中心建设成效将初步显现，到2030年，全面建成世界知名的综合性科学中心。

2017年5月，国家发展改革委、科技部联合批复了《北京怀柔综合性国家科学中心建设方案》，同意建设北京怀柔综合性国家科学中心，北京怀柔综合性国家科学中心也成为了继上海张江、安徽合肥后批复的第三个综合性国家科学中心。

2018年，北京怀柔综合性国家科学中心建设将全面展开，全市将争取实现国家高新技术企业达到2.2万家、技术合同成交额超过4800亿元，创业投资额占全国比重三分之一左右等目标。

2022年10月17日，怀柔综合性国家科学中心首个正式运行的国家重大科技基础设施项目“地球系统数值模拟装置”顺利通过国家验收，正式开放运行。

截至2023年7月，在央地协同、部市共建、院市合作大力推动下，经过6年努力，怀柔科学城已从建设为主全面进入建设与运行并重的新阶段，“十三五”布局的29个科学设施平台2022年土建工程已全部完工，2023年将实现三分之一正式运行、三分之一试运行、三分之一进入科研状态。

北京怀柔综合性国家科学中心的规划设计和建设，会汲取国际著名科学城的建设经验，按照国际一流标准进行。按照建设规划，到2020年，北京怀柔综合性国家科学中心建设的成效将初步显现；

到2030年，建成世界级的国家重大科技基础设施集群，在六大科学领域取得重大原创突破，全面建成世界知名的综合性国家科学中心。

依据方案目标，今年全社会研究与试验发展经费投入强度保持在6%左右；每万人发明专利拥有量98件左右，居全国首位；同时突出关键共性技术、前沿引领技术、颠覆性技术创新等。北京市提出要在新能源智能汽车、新材料等十个高精尖产业领域，促进形成从基础研究、技术开发、成果转化产业化发展的完整链条；国家高新技术企业数量达到2.2万家，处于全国前列；技术合同成交额超过4800亿元，创业投资额占全国比重三分之一左右，居全国首位。