1998年，计算机学院在整合了原来的计算机硬件实验室和计算机软件实验室的基础上，按照计算机学科的布局和高水平人才培养的要求，建设成立了计算机教学实验中心，完成了以面向计算机学院本科生教学实验为主的计算机专业教学实验体系的基本布局。从1999～2000年，在“九五”、“211工程”和学校专项实验经费的支持下，教学实验中心完成了计算机组成原理实验室、计算机软件实验室、微机实验室和面向全校非计算机专业本科生的计算机文化基础实验室等建设或改造，完成了面向本科生的计算机实验教学环境的建设。

2001年，计算机学院开展了以“本研一体化、以重点实验室为重要培养基地、研究与工程相结合”三种培养模式为主要特征的研究型学院人才培养体系的研究与探索，教学实验中心也因此同步开展了以“本研一体化、教学与研究相结合”为主要特征的研究型学院教学实验体系的研究与实践工作，并按照计算机学科本研一体化的总体要求，以培养创新性人才为主要目标，调整了教学实验中心的总体结构，并逐步开展了相应的教学实验体系的建设，面向全校本科和硕士研究生提供先进的、满足不同层次人才培养需求的教学实验服务。

2001年在“教育振兴计划”的支持下，改造完善了面向全校电类学科的计算机接口与通信实验室，在随后的“十五”、“211工程”和“985（一期）工程”的专项经费支持下，先后完成了EDA实验室、计算机文化基础实验室、先进计算机网络技术实验室、嵌入式计算机系统实验室、计算机体系结构实验室、科技创新实验室等实验室的改造或建设。

经过8年的建设，目前，教学实验中心拥有13个专门实验室，教学实验设施总价值3570余万元，专用实验用房面积1783平米，服务对象遍布全校19个学院或专业，平均年教学实验学时达到172万。计算机学院教学实验中心已经建设成为一个具有坚实的学科基础、拥有先进的实验体系和一流的实验环境的实验教学基地和工程创新能力培育基地，在研究型学院的精英式人才培养过程中发挥着巨大的作用，其整体水平和建设规模居国内高校计算机专业前列。