中国医学科学院阜外医院始建于1956年，是一所集医疗、科研、预防和人才培养于一体的三级甲等专科医院，是北京市医保定点单位。

根据《中央编办关于国家卫生健康委所属事业单位机构编制的批复》(中央编办复字〔2018〕90号)，设立中国医学科学院阜外医院，为中国医学科学院北京协和医学院所属事业单位。

（一）贯彻执行党的卫生健康工作方针政策，承担医药卫生体制改革任务，提供优质高效的心血管及相关疾病的医疗卫生服务，承担疑难杂症诊疗工作。

（二）承担北京协和医学院临床教学工作，承担心血管病学及相关专业学科建设和教育教学工作，培养相关专业高水平临床及科研人才，建设一流学科。

（三）建设高水平创新科研技术基地平台和保障体系，组织开展心血管病学及相关专业科学研究和技术创新，推动科技成果转化，指导监督所属企业运行和发展。

（四）协助制订相关专业发展规划，拟订心血管等相关专业诊治技术规范、标准和指南，为专业发展提出政策建议。承担相关行业学（协）会的管理工作。

（五）承担心血管病及相关专业领域疾病预防控制、健康教育、科学普及、突发公共事件的应急救援等公共服务职能。

（六）承担干部医疗保健和重要医疗保障任务。承担支边、扶贫、对口支援等任务。

（七）组织开展心血管疾病及相关领域学术交流合作，出版发行相关学术刊物。

（八）承担中国医学科学院北京协和医学院交办的其他事项

医院总用地面积5.53万平方米，总建筑面积15.7万平方米；预防研究区（门头沟西山园区）总用地面积7.33万平方米，总建筑面积为3.7万平方米，未来将达到9.2万平方米。医院设有36个病房，26个手术室（其中包含5个复合技术手术室），17个导管室，1521张编制床位数，实际开放床位数1291张。在职员工3571人，中高级职称专业技术人员1440人（数据截至2020年12月31日）。同时，配备有血管造影机、双源CT、核磁共振、PET-CT等与世界接轨的医疗科研设备。

1956年，中国人民解放军联合北京协和医院在解放军122疗养院的基础上，成立以防治肺结核为重点的中国人民解放军胸科医院（310医院），即“中国医学科学院阜外医院”的前身。

1958年中国人民解放军胸科医院定名为中国医学科学院阜成门外医院。

1994年更名为中国医学科学院阜外心血管病医院。

2014年更名为中国医学科学院阜外医院。

2020年10月10日，被北京市医保局确定为第二批开通京津冀异地就医普通门（急）诊直接结算业务试点定点医疗机构。

2023年7月12日上午，由国家心血管病中心、中国医学科学院阜外医院联合发起的“国家心血管病中心先心病一体化专科联盟”在北京正式成立。

2023年10月，由国家心血管病中心、中国医学科学院阜外医院联合发起的“国家心血管病中心生活方式医学联盟”成立。

医院设有冠心病中心、心律失常中心、急重症中心、心力衰竭中心、肺血管病中心、高血压中心、临床药理中心、血脂异常与心血管病诊治中心、内分泌与心血管病诊治中心、血栓性疾病诊治中心、特需医疗中心、成人外科中心、血管外科中心、小儿外科中心、术后恢复中心、麻醉中心、体外循环中心、放射影像中心、超声影像中心、核医学影像中心、功能检测中心、临床检验中心等临床和医技科室。

2021年4月25日，获得“2021年首都劳动奖状”荣誉称号。

2022年3月16日，被表彰为“冬奥网络安全卫士”。

北京市西城区北礼士路167号