光绪二十九年（1903年）癸卯会试第十八名贡士，殿试三甲进士。钦点翰林院庶吉士，授翰林院检讨。外放福建省候补道，因没有空缺不能上任。后受聘为旅京南海公学学监。宣统年间被派往
日本早稻田大学学法律。民国成立后，受聘为广东省省长公署高级顾问。民国三年（1914年）任广东省公立法政专门学校（国立中山大学前身之一）校长。1927年移居香港。擅长书法艺术，他的馆阁体书法，字体工整大方、苍劲有力。
区大原在香港期间，曾任香港大学、汉文中学、岭岛中学、学海书楼中文教习。1933年兼任
香港孔教学院副院长。其间与清代遗老江孔殷、桂坫、谈道隆、朱汝珍、温粛、赖际熙等组织正声诗社，课诗之外，竞为诗钟，将各人所赋之诗汇编成《正声吟社诗钟集》。
1941年日本侵占香港，他拒绝了日本人和汉奸的合作要求，毅然迁离香港，返回家乡区村设馆授徒。搬迁之时曾将所存经史碑帖医学等线装古书约三千册，悉数交香港大学冯平山图书馆保管，这批书籍于1961年由其后人捐赠给
广东省文史馆，从香港运回广州珍藏保存。
1944年夏，广东西江水涨，冲缺堤围，区村一片哀鸿，加以盗匪猖獗，乡人为了自救，成立筑堤修围筹委会，推举区大原为主任，大岗圩梁某为副，立秋节后不久便筑起堤栏，抢插晚稻。区大原因年事已高，积劳成疾，于1945年2月去世，享年七十七岁。殡葬之日，乡人哀之，临亍致祭，并写出挽联：“历八月之精神、策划经营、筑秋栏、修大基、无时或息；欠一篑之工作、中道辞世、继其志、善此事、尚有何人？”