由于十三行遗址在台湾史前史中的重要地位，考古学者通常将台湾北部地区史前时代晚期文化通称为「十三行文化」。除了十三行遗址之外，位于台北市中山区的西新庄子遗址，也是十三行文化的代表性遗址之一。
十三行文化属于北台湾地区的金属器时代，时间大致从2,300年前开始，到汉人进入本地区之后才结束，是台湾
史前文化的代表文化之一。十三行文化的主要特征是石器减少，只剩下凹石、
石槌等无刃器。从出土的铁渣、矿石等矿物，显示当时人已知炼铁。除了
石、
铁外，还有为数不少的
陶器，主要是红褐色
夹砂陶，特征是手工制作，含细沙，火候高、质地坚硬。
如果以史前文化较宽的定义而言，台湾北部地区拥有赤褐色或浅褐色拍印几何纹硬陶的史前遗址，都属于广义十三行文化的范畴。就此而言，十三行文化的分布地区，在西海岸地区由
淡水河沿着海岸向南一直分布到大安溪，向东则沿着北海岸、
兰阳平原一直分布到奇莱平原北侧的
三栈溪。
根据考古学者
刘益昌的看法，根据时间、分布区域及文化内涵，十三行文化可以再区分为早、晚两期及七个不同的类型。其中早期为年代距今2000-1000年之间，包括十三行类型、后龙底类型、番社后类型；晚期年代距今1000年以内，包括埤岛桥类型、新港类型、旧社类型与普洛湾类型。