华东理工大学药学院是华东理工大学下设的二级学院。

1953年，化学制药工学专业（有机工业系）设立。

1971年，化学制药专业（有机工业系）设立。

1978年，化学制药专业（应用化学系精细化工系）设立。

1985年，化学制药专业（精细化工系）设立。

1993年，新设药物制剂专业（精细化工系）设立。

1996年，制药工程（化学制药/药物制剂）（精细化工系）设立。

1999年，制药工程系成立。

2004年9月，药学院成立，蒋华良任院长，任德权任名誉院长。

2005年1月，上海市化学生物学（芳香杂环）重点实验室（药物化工研究所）整体进入药学院；2月，中药现代化工程中心成立；4月，自设化学生物技术与工程二级学科博士点；12月，药学本科新专业获批招生。

2006年1月，新增药物化学和农药学两个二级学科博士点，新增药学、中药学和植物保护三个一级学科硕士点；3月，制药工程系从原化学与制药学院整体划归药学院；6月，药物科学系成立；9月，药学本科专业首批新生入学；12月，药学实验教学中心成立。

2007年10月，制药工程与过程化学教育部工程研究中心获批建设。

2008年1月，制药工程专业入选教育部特色专业。

2009年6月，华东理工大学GMP研究中心成立（隶属药学院）；10月，药学一级学科博士后科研流动站获批设立

2010年5月，制药工程专业入选教育部首批“卓越工程师计划”试点；10月，新增药学、中药学硕士专业学位授权点。

2011年3月，获得药学一级学科博士学位授予权；9月，组建首个“制药工程卓越工程师”班；11月，上海市新药设计重点实验室（筹）获批建设。

2012年6月，获批与上海医药集团共建国家级工程教育实践中心；10月，植物保护一级学科博士后科研流动站获批设立。

根据2021年11月学院官网信息显示，学院下设药物科学系、制药工程系2个教学系，开设制药工程、药物制剂、药学3个本科专业。

根据2021年11月学院官网信息显示，学院有专任教师107 名（其中博士后人员18名），正高39名、副高40名、博士生导师46名（其中兼职导师12名）；学院有包括中国工程院院士在内的国家级重点人才13人、省部级人才称号获得者40人。

专职院士：钱旭红（中国工程院院士）

国家杰出青年基金获得者：钱旭红、杨弋、李洪林

国家优秀青年基金获得者：李洪林、李剑、杨丙成、赵玉政、杨有军

科技部中青年科技创新领军人才：李忠、杨弋、李洪林、李剑

教育部新世纪优秀人才支持计划入选者：杨弋、李忠、邓卫平、唐赟、李洪林、李剑、叶金星

根据2021年11月学院官网信息显示，学院有国家级一流本科专业建设点2个，国家级特色专业1个，教育部“卓越工程师计划”试点专业1个，教育部专业综合改革试点1个，国家级工程实践教育中心1个，设有药学实验教学中心，制药工程专业国家工程教育专业认证。

国家级一流本科专业建设点：制药工程、药学

国家级特色专业：制药工程

教育部“卓越工程师计划”试点专业：制药工程

教育部专业综合改革试点：制药工程

国家级工程实践教育中心：上海医药集团

根据2021年11月学院官网信息显示，学院有博士后科研流动站2个，一级学科博士点1个，二级学科博士点1个，一级学科硕士点2个，二级学科硕士点2个，专业硕士学位类别2个，上海市重点学科1个，上海高校一流学科（B类）1个，教育部第四轮学科评估药学学科进入B+行列，药理学与毒理学、农业科学进入ESI全球学科排名前1%。

博士后科研流动站：药学、植物保护

一级学科博士点：药学

二级学科博士点：农药学

一级学科硕士点：药学、植物保护

二级学科硕士点：制药工程、药学

专业硕士学位类别：生物与医药类工程、药学

上海市重点学科：农药学

上海高校一流学科（B类）：药学

根据2021年11月学院官网信息显示，学院设有上海市化学生物学重点实验室、上海市新药设计重点实验室、制药工程与过程化学教育部工程研究中心、GMP研究中心。

根据2021年11月学院官网信息显示，学院累计承担着国家自然科学基金、科技部973计划、863计划、卫生部、总后勤部“重大新药创制”科技重大专项、国家重点研发计划、教育部创新引智工程、国基金重点项目、“重大新药创制”科技重大专项等国家和省部级科研项目400余项。累计科研经费到款约4.5亿元。在Nature子刊、Cell子刊、PNAS、J. Am. Chem. Soc.、Angew. Chem. Int. Ed.、J. Med. Chem.等该领域刊物发表研究论文60余篇，共计申请专利440余项，获授权专利217项。已取得以国家科技进步二等奖，教育部自然科学一等奖，上海市自然科学一等奖为代表的27项获奖科研成果。在成果转让方面，近五年来，已有2个农药创制品种获得农药登记证并成功转化，6项新药转让项目合同金额超过1000万元，其中3项合同金额超过1亿元。

根据2021年11月学院官网信息显示，学院与加拿大多伦多大学药学院、德国维尔茨堡大学药学与食品化学研究所、英国阿尔斯特大学药学院，英国萨里大学，新西兰奥克兰大学等建立了合作关系，与英国萨里大学，阿尔斯特大学，克兰菲尔德大学等建立了3+1学生交流项目；并与英国牛津大学，美国康奈尔大学，英国邓迪大学，英国伯明翰大学，加拿大不列颠哥伦比亚大学等建立了寒暑期短期交流项目；参与了法国化学工程师联盟FGL3+3项目；先后邀请了美国新墨西哥大学、英国贝尔法斯特女王大学、日本京都大学、韩国明知大学等校的学者前来上课，并合作培养学生。

根据2021年11月学院官网信息显示，学院举办“良师伴我行”系列讲座，举办“互联网+”大学生创新创业大赛辅导交流会，组织参观“城市荣光——庆祝上海解放70周年”主题展览。