华南农业大学工程学院为华南农业大学二级学院。

1958年，成立“农业机械化教研室”。

1961年，由“农业机械化教研室”成立“农业机械化系”。

1984年，“农业机械化系”更名为“农业工程系”。

1993年，“农业工程系”易名为“工程技术学院”。

2001年，“工程技术学院”更名为“工程学院”。

2015年，“电子信息类”三个本科专业并入，更名为电子工程学院。

2016年，农业工程学科在教育部第四轮学科评估获评B+。

2024年10月21日，华南农业大学工程学院“强农”教育基金成立。

截至2020年5月，学院设有6个本科专业，6个教学系。

本科专业：农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、交通运输、车辆工程、工业设计、电气工程及其自动化、自动化

教学系：农业工程系、机械工程系、车辆工程系、自动化系、工业设计系、实验教学中心

截至2020年5月，学院有在职教工112人，其中具有正高职称22人，副高职称38人，中级及以下职称52人，具有博士学位64人，博士生导师18人。有中国工程院院士1人，国家级教学名师1人，国家“万人计划”科技创新领军人才1人，国务院学位委员会农业工程学科评议组成员1人，全国师德先进个人1人，国家现代农业产业技术体系岗位科学家7人，享受国务院政府特殊津贴3人，1个国家级教学团队。

中国工程院专职院士：罗锡文

国家级教学名师：罗锡文

国家“万人计划”科技创新领军人才：杨洲

享受国务院政府特殊津贴：李长友等

国家级教学团队：农业机械学教学团队

截至2020年5月，学院有1个一级学科博士点，2个一级学科硕士点，2个专业硕士授权类别，1个国家重点（培育）学科，1个广东省攀峰重点学科。农业工程学科在2016年教育部第四轮学科评估获评B+。

一级学科博士点：农业工程

一级学科硕士点：农业工程、机械工程

专业硕士授权类别：工程、农业

国家重点（培育）学科：农业机械化工程

省攀峰重点学科：农业工程

截至2020年5月，学院有1个国家级特色专业，1个国家综合改革试点专业，1个广东省特色专业，2个广东省名牌专业，1个国家级精品课程，1个中国大学资源共享课。

国家级特色专业：农业机械化及其自动化

国家综合改革试点专业：农业机械化及其自动化

省特色专业：机械设计制造及其自动化

省名牌专业：交通运输、机械设计制造及其自动化

国家级精品课程：农业机械学

中国大学资源共享课：农业机械学

截至2020年5月，学院获国家级教学成果奖1项、省级教学成果奖6项。

2021年，学院学生在第七届“两岸新锐设计竞赛--华灿奖”获一等奖；在“信联杯”包装创意设计大赛决赛中多个奖项；“空中机器人”团队在CADC中国国际飞行器设计挑战赛总决赛中再获佳绩；在“未来农机-无人农场的领航者”项目荣获第七届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛金奖。

截至2020年5月，学院有南方农业机械与装备关键技术教育部重点实验室、水田农业装备技术农业部重点实验室和广东省科技厅国际农业航空施药技术联合实验室；拥有广东省农业航空应用、广东省水稻移栽机械装备、广东省山地果园机械创新和广东省果蔬农产品冷链物流装备4个省级工程技术研究中心；拥有水稻、柑橘、甘蔗、荔枝龙眼、香蕉、棉花6个国家现代农业产业技术体系机械化研究室。

截至2020年5月，近五年，学院教师主持省部级以上科研项目150余项，其中SCI、EI收录230余篇，出版专著与教材26部，授权发明专利280多件，获省部级科研成果奖20余项，其中罗锡文院士团队的“水稻精量穴直播技术与机具”获国家技术发明奖二等奖。承担包括国家自然科学基金项目、国家重点研发计划专项在内的主要科研项目近50项，项目经费超过1.8亿元。

截至2020年5月，学院先后与英国Silsoe学院、Silsoe研究所，美国华盛顿州立大学、麻省州立大学、肯塔基大学、堪萨斯州立大学、俄克拉荷马州立大学，加拿大McGill大学，法国蒙彼利埃高等农学院、法国国家环境与农业科技研究院，澳大利亚农业工程研究中心、昆士兰大学、悉尼大学、南昆士兰大学，日本东京大学、山形大学，泰国宋卡王子大学，英国卡迪夫大学、邓迪大学和新加坡南洋理工大学等单位建立了学术交流与合作关系。

学院曾开展大学生创新创业训练项目推进会、2020级专业思想教育暨学习交流会；举行党史学习教育之庆祝建党100周年学生艺术作品展暨校友企业捐赠仪式。