单倍群N与单倍群M是单倍群L3的两个直接后裔分支，M来自第一波走出非洲的大迁徙，N则来自第二波。M的路线是通过
红海，N的路线是沿着
尼罗河，通过
西奈半岛走出非洲，因为沿着尼罗河沿岸迁徙可以找到足够的水和食物。这些走出非洲的L3后裔构成了单倍群N。
N的早期成员生活在地中海东北和亚洲西部，可能当地仍存在着
尼安德特人。在以色列的卡巴拉洞穴出土了约6万年前的尼安德特人遗骸，说明当时这两种人科生物生活在同一地区。
单倍群N的成员组成很多群体，向各大洲（除南极洲、非洲外）进发，N被认为是亚欧大陆西部的单倍群，因为在
中东和
欧洲的几乎所有线粒体血统中都发现了N。