南京大学中华民国史研究中心从事中华民国史研究的学术单位之一。2000年9月，中心被批准为教育部普通高等学校人文社会科学重点研究基地。

中心的主旨是提高研究水平，进一步推动民国史研究的发展，加强海内外学术联系与交流。

从20世纪70年代中期开始，该系的部分教师即充分利用独特的地缘及档案资料的优势，联合当地的学者共同开展中华民国史的学术研究。

1983年，在历史研究所内建立民国史研究室，成为中国大陆地区最早从事中华民国史研究的学术单位之一。

2000年9月，南京大学中华民国史研究中心被批准为教育部普通高等学校人文社会科学重点研究基地。

张宪文教授担任主任，民国史中心还聘请了海内外在民国史研究领域卓有成就的62位学者担任客座教授。

近年来编辑出版了高水平的学术刊物《民国研究》（已出版30辑）；承担完成了包括国家社科重点规划项目、教育部重大课题攻关项目在内的多项科研项目；主办了第3次（1994）、第4次（2000）中华民国史国际学术讨论会、两次民国史中青年学者国际学术研讨会（1995、2002）及其他重要学术活动。中心学者出版了《蒋介石全传》（上、下）、《中华民国史大辞典》、《中国抗日战争史（1931-1945）》、《中华民国史》（4卷本）、《南京大学中华民国史研究中心研究丛书》（《中华民国史新论》等9本）、《南京大屠杀史料集》、《南京大屠杀史研究（增订版）》等一批学术著作；接待过海内外的大批访问学者、进修生和研究生；中心学者也多次赴欧美、澳洲、日韩等国家及台港澳地区进行学术访问与交流。