南京大学于1989年开始实施“大理科人才培养模式”，是全国最早开始探索多学科综合发展的
高校之一。20年来，这一模式的实施平台也由最初的基础学科教学强化部、南京大学基础学科教育学院发展到今天的匡亚明学院，创建了从课程体系到培养模式的一整套大理科人才培养系统。它强调宽厚基础和注重学科交叉；鼓励学生跨学科选课；注重研究性教学，将科研训练列入教学计划；贯通本科和研究生教育，现在每年有80%以上本科毕业生继续攻读研究生。大理科教学模式也为南京大学正在开展的“三三制”学生培养模式提供了理论和实践上的借鉴意义。
首届全国高等教学名师、《
大理科模式20年——思想、举措、人才》的作者卢德馨教授指出，大理科培养模式的意义在于打破传统的学科设置，鼓励学生进行多学科交叉学习。大理科培养模式自实施以来培养了一大批兴趣广泛、创新优势突出的优秀人才；形成了一支高质量的教学团队；探索出一条多方共赢的可持续发展的教学道路。
在“大理科教学模式”基础上，南京大学实施“基础学科拔尖学生培养计划”（珠峰计划）方案，该方案是依托现有的“大理科”人才培养模式为基础，进一步革新课程体系，量身定做拔尖人才的个性化培养方案。南大将为入选培养计划的本科生实施个性化的课程培养体系，并提供条件支持；引进国际最新原版教材；本科阶段配备一对一的导师；提供更多的国外交流、学习机会以及相应的条件保证等。据悉，该方案将从2009级新生起开始实施。该方案的推行将有利于构筑拔尖人才培养的绿色通道，全面推行研究性教学，计划在10到20年内为基础学科领域培养具有国际一流水平的未来领军人物和拔尖创新人才。
2009年 12月26日，南京大学举行创建大理科教学模式20周年庆典，《大理科模式20年——思想、举措、人才》一书同时发行。仪式由匡亚明学院院长
许望主持。南京大学党委常委、组织部部长王志林，教务处、学工处负责人，相关院系师生代表等，以及教育部理工处、国家自然科学基金委、
清华大学出版社等单位的嘉宾出席了庆典仪式。庆典仪式后，来自清华、北大、复旦、浙大、中科大等院校的专家学者还就如何培养拔尖创新人才进行了深入的讨论。