南京大学宗教与文化研究中心是以南京大学哲学系、宗教学系为依托，整合南京大学中国古代文学、南京大学中华民国史研究中心、中国思想家研究中心和社会学系等院系和学科的相关学术力量组建起来的财政部、教育部哲学社会科学创新基地。

在宗教学研究方面，南京大学有着悠久的学术传统。著名学者汤用彤、方东美、唐君毅、牟宗三，在中央大学（南京大学前身）任教期间，对于佛教乃至整个宗教学就有很深入的研究，如汤用彤名著《汉魏两晋南北朝佛教史》、《隋唐佛教史稿》等，就形成于其在中央大学任教期间的教学讲义；建国以后，作为南京大学中国哲学学科开创者的孙叔平教授，是我国以历史唯物主义为指导研究包括佛教在内的中国古代哲学的著名学者之一。接续这种学术传统，南京大学自八十年代以后，逐渐形成一支队伍比较整齐、年龄结构比较合理的宗教学教学和研究梯队。

学科带头人、中心主任赖永海教授是我国创设学位制度以来第一位以佛学为研究方向取得博士学位的中年学者，85年博士生毕业后一直致力于中国佛学、佛教与中国文化的研究，相继出版《中国佛性论》等专著16部，主编了国内第一部《中国佛教百科全书》；中心专家委员会成员徐小跃、洪修平、陈谦平、张宏生、徐新、李承贵教授，近十几年来，在佛教禅学、三教关系、民间宗教、西藏文化、犹太文化、佛学与儒学等研究领域相继推出一批颇具影响力的学术成果，逐渐形成以中国佛学、三教关系、佛教与中国文化、民间宗教、犹太教与犹太文化为主要方向的学科研究体系。

作为“985工程”（二期）哲学社会科学创新基地的“宗教与文化研究中心”，目前正严格遵照财政部、教育部关于基地建设的有关要求，在进一步强化学科建设，大力提升学科水平同时，吸纳了一批海内外研究宗教文化的著名学者，对作为基地建设重要组成部份的若干重大研究课题进行集体攻关，其中包括12卷本的《中国佛教通史》、六册一辑的“宗教文化专论”（包括《宗教与哲学》、《宗教与科学》、《宗教与文学》、《宗教与政治》、《宗教与伦理》、《宗教与逻辑》）、五册一辑的“宗教文化概论”（包括《佛教与中国文化》、《基督教与西方文化》、《伊斯兰教与阿拉伯文化》、《印度教与印度文化》、《犹太教与犹太文化》）、八册一辑的“无神论与马克思主义宗教学”和六册一辑的“东方宗教与哲学”等。