南京海运学校创始于1951年。是由中央人民政府交通部和中国海员总工会举办的海员训练班。

南京海运学校创始于1951年。时由中央人民政府交通部和中国海员总工会举办的海员训练班，选拔全国各地海河船舶的船员与基层单位干部进行政治教育与工会业务短期培训。

从1951年1月～1952年11月，经四期轮训，培养了2721名船员和基层工会干部，并对部分起义人员进行了培训。

1953年1月，海训班改建为海员干部学校，学制1年。旨在培养提高各水运单位在职干部和部分工人骨干的政治思想水平与工作能力。

1953年1月～1954年11月，共办两期，培训学员1222人。

1955年，为适应航运事业发展，交通部决定将海员干校改建为技术学校。由上海海运局等单位调拨一批船舶设备与实际操作器材，并添置了一批教育仪器与设备，建立了实验室、专课教室、实习工厂、车间与水上训练码头艇站。

经过一年筹建，1956年秋开始对外招生，改名为南京初级航海学校，由交通部海运管理总局领导，参照中等专业学校章程办校。

1957年9月，经交通部海运总局与劳动部研究确定，学校为技工性质，改名为南京海运工人技术学校，划归交通部上海海运局领导。其间学校一面对外招生培养新船员，一面为上海海运局举办各类短训班，轮训水手、生火、机匠，同时还选拔德才较好的水手、机匠进行8个月的专业训练，培养成为驾驶员、轮机员。

1960年1月，交通部决定该校改为中专，命名为交通部上海海运管理局南京海运学校，设置驾驶、轮机两专业，学制3年。

1961年3月，国民经济调整，鉴于学校师资设备等条件还不充分，复经交通部决定调整为技工学校，命名为海运技工学校，改驾驶、轮机两专业为水手、机匠专业。并相继开办船电、车工、钳工等专业。

1957～1964年，在归上海海运局领导期间，该校通过全日制和短训班，共为上海海运局培养船员2401人，其中指导员83人，驾驶员84人，轮机员85人，船舶技术工人2149人（全日制1396人，短训班1005人）。

1964年8月，交通部决定该校划归交通部远洋运输局领导，改名为南京远洋技工学校。

1965年改名为南京远洋海员学校。

1990年4月改名为南京海运学校，仍隶属交通部远洋运输局领导。

2003年7月经江苏省人民政府批准南京海运学校和南京航运学校合并组建成江苏海事职业技术学院

院 长：刘红明 博士 研究员

书 记：马长世 教授

副书记：刘志洲

副院长：陈立军 教授

副院长：王卫兵 研究员

副院长：田乃清 研究员

副院长：陈晓琴 教授

学院现代化教学基础设施完备。数字化校园网络开通了近万个信息点，连接教学科研计算机达1000多台。构建了集基本技能训练-仿真模拟操作训练-实船适岗综合训练于一体的“立体化”实训体系，形成学院实践教学特色。校内建有国家级实训基地航海技能评估基地，省级实训基地轮机技能评估基地，校级实训中心10个、研究所8个。省劳动保障厅在学院设立国家职业技能鉴定所。图书馆有纸质流通图书48万册，电子图书520GB。

板桥实训基地占地面积近10亩，水岸线长达420米，先后拥有育海、育人、育才、龙山、育航等六条实习船。现有的万吨级远洋轮育睿号轮是国内处于适航状态的教学实习船，船上装备齐全、设施配套，可供200人驻站学习，充分满足了航海、船舶全真实训教学需求。