北京大学南南合作与发展学院于2016年4月29日在北京大学
朗润园挂牌成立。北京大学南南合作与发展学院中文简称南南学院，英文名为Institute of South-South Cooperation and Development，英文简称ISSCAD，是习近平2015年9月26日在
纽约联合国总部出席并主持南南合作圆桌会时宣布设立。南南学院由
中华人民共和国商务部主管，商务部综合考量各高校的定位与优势，最终委托
北京大学主办，由
北京大学国家发展研究院承办。
南南学院由
商务部主管。经商务部综合考量各高校的定位与优势，最终落户北京大学，并由北大国发院来承
南南学院的课程，主要分为领导力、发展经济学以及国家与发展三个模块，好比一棵大树的树根、树干和树枝。他希望这些方面的课程，能够帮助到这些发展中国家里有潜力的官员，未来成为该国家的领袖。
商务部为南南学院国家发展硕士和博士项目提供资助，并为录取的学员提供必要的教育和生活经费。南南学院首年将招生30位研究生，攻读公共管理相关课程（学制1年），同时还将招收10名博士，攻读理论经济学相关课程（学制3年），学员分别来自发展中国家政府的初级与中高级官员。
南南学院由
北京大学国家发展研究院联合创始人、名誉院长林毅夫教授担任院长，北京大学国家发展研究院院长姚洋教授担任执行院长，北京大学国家发展研究院傅军教授担任学术委员会主任。