民国元年（1912）广西都督陆荣廷将广西省会由桂林迁来南宁，将巡警区署改为南宁警察厅，直接受广西军政府内务司（民政厅的前身）领导。

厅址在石牌坊街大树脚前清守卫衙门（今民乐路接共和路处）。设厅长1人，总管全厅职权。厅内部设秘书室、总务科、行政科、司法科、卫生科、督察室、警卫队、警备队、侦探队、消防队、清洁队；厅外部设第一、第二、第三区和水上警察厅。第一区警察署，署址在观音阁（今民族大道广西国际贸易中心大厦左后侧） ，辖兴宁、明德、宁武、东门4个分驻所；第二区警察署， 署址在水闸门（今邕江一桥北岸六角亭处），辖维新、宣化、临江、亭子4个分驻所；第三区警察署，署址在会馆街华光庙（今壮志路小学附近），辖永宁、沙街、上国、秀安4个分驻所。各区警察署均设署长1人，一等、二等、三等署员各1人，班长3人，警士3班至5班。