南方过渡委员会成立于2017年5月，由当时遭也门总统哈迪罢免的亚丁省省长祖贝迪联合南部26名部落、军政领导人组建而成。

2017年，遭也门总统哈迪罢免的亚丁省省长祖贝迪联合南部部落、部分军政领导人组建南方过渡委员会，寻求南部地区独立。

2019年8月，南方过渡委员会武装与也门安全部队发生冲突，并占领亚丁市包括总统府在内的大部分重要设施，随后将部分设施归还给也门政府。同年11月初，双方在沙特首都利雅得签署一项权力分配协议，同意共同组建新政府。

2020年4月26日，也门南方过渡委员会宣布，即日起在包括临时首都亚丁在内的南部各省份实行自治。

“南方过渡委员会”控制着也门临时首都亚丁和部分南方地区。

2020年6月20日，也门南方过渡委员会控制了也门南部战略岛屿索科特拉岛。

2021年8月29日，也门临时首都亚丁北部的阿纳德军事基地遭袭击后，实际控制该基地的也门南部分裂势力南方过渡委员会下属武装力量“南部武装力量”在当地时间29日晚间，由其发言人穆罕默德·纳吉布（Mohamed Al-Naqeeb）发表讲话，证实当天上午8时30分左右发生的袭击事件共造成至少30人死亡，另有60人受伤。