南疆铁路（Southern Xinjiang Railway），简称南疆线，是中国一条连接新疆维吾尔自治区吐鲁番市吐鲁番站和新疆维吾尔自治区和田市和田站的国铁双线电气化铁路（阿克苏至喀什段单线），是中国国家“九五”重点工程，也是新疆维吾尔自治区主要的铁路干线。

1912年（中华民国元年），孙中山先生就用红笔划出了南疆铁路。

1927年，中华民国政府又聘请瑞典科学家斯文赫定专门带着一支科考队，踏勘南疆铁路。但此次对南疆铁路的线路勘察仅停留在图纸上并无实质性行动。

1958年，新疆巴音郭楞州人民在全中国大炼钢铁，大办粮食，大修铁路的口号激励下，提出要修建库尔勒至库尔楚地方铁路，全长74.21千米。

1959年底，成立铁路工程指挥部，出动3700人，拖拉机一台，大车81辆，毛驴车21辆，毛驴子398头，大动土木，伐原木3700方，完成路基5640方，1961年路基工程完工。

1962年，国民经济调整，撤掉了南疆铁路指挥部、南疆铁路停建。

1974年4月，南疆铁路第一期工程吐鲁番至库尔勒段动工修建，国家共投入劳力8.4万人，各种车辆3600辆，各种机械8000台，于1979年完成路基工程，1979年8月铺轨到库尔勒西站。

1984年，国家组织各方面专家学者论证确认，认为选线合理，设计适当，施工质量良好，对各项工程表示满意，国家同意验收。1984年8月30日，南疆铁路吐库段正式通车。

1996年4月，南疆铁路第二期工程库尔勒至阿克苏段动工修建，国家投入劳力12万人，各种车辆5000余辆，各种机械万余台，于1997年完成路基工程，1997年4月20日正式铺轨，全长500千米。

1998年6月22日，南疆铁路提前铺轨到阿克苏。

1998年12月1日，南疆铁路库阿段开通运营。

1999年12月6日，南疆铁路全线贯通。

2024年7月18日，乌将铁路、南疆铁路部分区段万吨试验列车开行成功，新疆试开万吨列车的铁路达到了3条。

2024年8月14日下午，一列自南疆铁路阿克苏站始发的74041次万吨列车抵达喀什站，南疆铁路阿克苏至喀什区段至此实现常态化开行万吨列车。8月18日，乌尉跨铁项目跨南疆铁路分离式立交桥左幅L13V型墩柱浇筑完成，标志着项目下部结构施工全部完成。

截至2003年，南疆铁路设87座车站。

南疆铁路东起兰新铁路上的吐鲁番市，从吐鲁番盆地，穿过天山沿着塔克拉玛干沙漠的北边缘，经库尔勒、阿克苏、阿图什，至新疆最西部的喀什，全长1446.37千米。

2015年10月20日起，南疆铁路开通乌鲁木齐至库尔勒间的城际列车，即“南疆之星—天鹅号”。乘火车从乌鲁木齐至库尔勒市，最快只需4小时30分钟。

1999年至2009年，南疆铁路客运量逐年猛增，每年增速均在30%以上，2009年旅客运输量为102.8万人（发送量为51.3万人），货物运输量为214万吨。

南疆铁路基本沿古“丝绸之路”的中路延伸，沿线地质、地貌、气候条件十分复杂，有45℃的高温戈壁沙漠，有零下三四十度的冰达板，还有常年刮着七八级强风的大风口。全线一半以上地段穿行于天山峡谷，修建隧道29座，架设桥梁463座，隧道总长为50余千米。特别是奎先达板段，海拔升至3000米以上，这里建有7座螺旋形隧道，其中奎先隧道长6千米。在100千米地段，列车要25次跨越狭沟桥梁。铁路进入焉耆盆地后，还要跨越流沙河，铁桥长达438米。

南疆铁路通车以来，坚持以安全运输生产为中心，克服险恶的地理环境和复杂的气候条件带来的种种困难，较好地完成了运输生产任务，为塔里木石油资源开发及南疆经济的繁荣发展注入了生机。在保卫边疆，建设边疆中，南疆铁路发挥出巨大的军事运输作用。特别是在1994年、1999年西部军事演习中，南疆铁路以严谨、高效、迅速的运输方式为演习的圆满成功提供出强大的运输保障。南疆铁路东起吐鲁番，西至南疆重镇喀什市，横贯新疆南部，全长1446.37千米，是连通新疆南部4地州的黄金通道，也是开发塔里木盆地油气资源、建设中国棉花基地的重要铁路。（中国中央政府官网 评）

2024年8月24日凌晨，受强降雨影响，位于新疆阿克苏地区的萨特玛站至金银川站间发生水害，致使南疆铁路阿克苏至喀什段中断行车。铁路部门已启动应急预案，封锁水害区间，调整列车运行方案，迅速组织500余人和近60台挖掘机、装载机等抢险机械连夜赶赴现场展开抢险。8月24日13时49分，经铁路部门全力抢修，因水害中断的南疆铁路萨特玛站至金银川站间线路已恢复开通。