为适应改革开放的需要，经部领导批准，1995年成立了卫生部国际紧急救援中心。主要工作是围绕卫生部工作重点，组织协调管理规范医疗紧急救援业务，并与境内外保险公司和救援组织合作，为台港澳同胞和境内外人士提供及时、便捷的意外伤害医疗紧急救援服务和就医绿色通道的服务。紧急救援办公室设在卫生部国际交流与合作中心。

1999年，在卫生部的领导和支持下，经各省卫生厅（局）推荐，卫生部成立了覆盖全国的卫生部国际紧急救援中心网络医院，并实施了认定管理。2008年6月，卫生部对网络医院进行了第四期认定工作，目前有31个省、自治区、直辖市的918家医院成为卫生部国际紧急救援中心的网络医院。

2008年第四期网络医院认定工作之后，为提高各网络医院的业务水平，加强救援中心与网络医院之间业务联系，2008年该中心举办了“灾难医疗救援体系建设研讨会”、2009年与澳大利亚昆士兰科技大学举办了“中澳灾难医疗救援研讨会”、2010年在国家会议中心举办了“灾难与突发事件医疗救援案例分析会”。此外，2008年、2009年该中心还组织网络医院代表到澳大利亚、美国和加拿大考察学习和培训。2010年该中心同澳大利亚昆士兰科技大学启动了人才培养合作计划，该中心将定期从网络医院中选派到昆士兰科技大学攻读硕士、博士学位的人员。

为了更加快捷、高效地向社会提供优质的医疗救援服务和高端绿色通道的服务，卫生部国际紧急救援中心建立了人员、设备、系统一体化相融合的呼叫中心平台。该呼叫平台采用美国3com公司24个坐席的硬件设备，拥有医疗专业背景和国外工作经历的呼叫员全天候24小时提供中英文双语服务。呼叫中心软件系统功能强大，具备接警时客户信息自动弹出、多方通话、GPS定位、数据存储、医疗档案管理等多项功能。