为适应卫生应急工作需要，进一步完善行政决策机制，卫生部2011年3月决定成立突发事件卫生应急专家咨询委员会，并制定了《卫生部突发事件卫生应急专家咨询委员会管理办法》。
卫生部突发事件卫生应急专家咨询委员会下设应急管理组、突发急性传染病组、
鼠疫防治组、中毒处置组、核和辐射事件处置组、紧急医学救援组、应急保障组、心理救援组等8个专业组，成员共计169人。卫生部突发事件卫生应急专家咨询委员会委员任期3年。
《卫生部突发事件卫生应急专家咨询委员会管理办法》指出，专家咨询委员会作为卫生部的咨询组织，应当遵循科学严谨、求实创新、主动参与的原则，发挥多学科、多专业的综合优势，积极开展卫生应急相关领域的研究，为完善国家卫生应急体系、应对突发公共事件提供决策咨询。