蕨类植物的原孢子，在小型叶类型的蕨类植物中，原孢子囊单生于原孢子叶的近轴面叶腋或叶的基部，通常很多 原孢子叶紧密地或疏松地集生于枝的顶端形成球状或穗状，称原孢子
叶球(strobilus)或原孢子叶穗(sporophyllspilte)，如石松和木贼等。大型叶的蕨类植物不形成原孢子叶穗，原孢子囊也不单生于叶腋处，而是由许多原孢子囊聚集成不同形状的原孢子囊群或原孢子囊堆(sorus)，生于原孢子叶的背面或边缘。原孢子囊的细胞壁由单层(薄囊蕨类)或多层(厚囊蕨类)细胞组成，在细胞壁上有不均匀的增厚形成环带(annulus)．环带的着生位置有种种形式，如顶生环带、横行中部环带、斜行环带、纵行环带等，这些环带对于原孢子的散布有重要作用。原孢子囊壁有由多层细胞构成（厚囊蕨亚纲）或一层细胞构成、（薄囊蕨亚纲）原孢子囊壁的细胞中往往有部分细胞的胞壁不均匀增厚，它们排列成带状，称为环带。环带有顶生，横行中部、斜行、纵行等类型。多数蕨类植物产生的原孢子在形态大小上是相同的，称为原孢子同型(isospore)，少数蕨类如卷柏属和水生真蕨类的原孢子大小不同，即有大原孢子(macrospore)和小原孢子(microspore)的区别，称为原孢子异型(Heterospore)。产生大原孢子的囊状结构叫大原孢子囊(megasporangium)，产生小原孢子的叫小孢子囊(miroslorangium)，大原孢子萌发后形成雌配子体，小孢子萌发后形成雄配子体。
原孢子一般微小，单细胞。由于它的性状不同，发生过程和结构的差异而有种种名称。植物通过
无性生殖产生的原孢子叫“无性原孢子”，如分生原孢子、孢囊原孢子、游动原孢子等；通过有性生殖产生的原孢子叫“有性原孢子”，如接合原孢子、卵原孢子、子囊原孢子、担原孢子等；直接由营养细胞通过
细胞壁加厚和积贮养料而能抵抗不良环境条件的原孢子叫“厚垣原孢子”、“休眠原孢子”等。原孢子有性别差异时，两性原孢子有同形和异形之分。前者大小相同；后者在大小上有区别，分别称大、小原孢子，并分别发育成雌、雄
配子体，这在高等植物较为多见。
原孢子囊常集生成原孢子囊群（堆）。原孢子囊群的着生方式有多种，原始类型生于枝顶特化的原孢子叶上而成穗状或圆锥状的原孢子囊穗，进化的类型着方式有：边生原孢子囊群，指原孢子囊群着生于
羽片的边缘，顶生原孢子囊群，生于羽片顶端；脉端生原孢子囊群，生于细脉先端，脉背生原孢子囊群，系生于细脉中部，穴生原孢子囊群，系生于羽片所形成凹穴处，也有布满于叶背者。原孢子囊群有者具盖，有者无盖。孢子囊群有圆形、肾形、条形等各种形状。
原孢子的形状常为两面形、四面形或球状四面形，外壁光滑或有脊及刺状突起或有弹丝。大多数种类的原孢子为一型，少数种类为异型（如卷柏），即有大、小原孢子之分。生有原孢子囊的叶或叶状结构。其形态与营养叶有所不同。在产生异形原孢子的植物，有大、小原孢子叶之分。着生大原孢子囊的为大原孢子叶，着生小原孢子囊的为小原孢子叶。蕨类植物中
卷柏属的大小原孢子叶集中在枝顶形成孢子叶穗。大小原孢子叶的数目和在原孢子叶穗中的着生位置因种而异。大小原孢子囊分别单生于同一原孢子叶穗上的大小原孢子叶的叶腋内。
裸子植物中松柏类的原孢子叶聚生成球果状，称原孢子叶球。其中由大原孢子叶形成的称大原孢子叶球（雌球花），生于当年新枝的顶端或叶腋；由小原孢子叶形成的称小孢子叶球（雄球花），生于当年新枝的鳞片叶的叶腋或枝顶。雌球花每1大原孢子叶（即珠鳞，又称
果鳞）近轴面基部着生1至多个裸露胚珠，胚珠内生有大原孢子囊。雄球花每1小孢子叶下面生2～9个小孢子囊。被子植物的心皮和雄蕊分别相当于大原孢子叶和小原孢子叶。不同植物原包子形态各异。
原孢子堆prosorus 即古生菌类中产生孢子囊群的细胞。光辉集壶菌（Synchytrium fulgens）的休眠孢子发芽后形成的细胞即属此例。在
月见草属（Oenothera）的茎、叶细胞内寄生生长，然后分裂成几个游动孢子囊。而原孢子指在形成孢子的原来的原生质中，核分裂后所生的多核部分。该部分成圆形，进而核分裂成数个之后，重新发生细胞质分裂，形成许多单细胞性的孢子。原孢子囊是产生原孢子的一种囊状结构的细胞叫原孢子囊。也就是说，原孢子堆产生原孢子囊，然后原孢子囊产生原孢子。
原孢子大量存在于蕨类植物中（药用植物较多）。如
铁线蕨、
卷柏、
贯众、
肾蕨、
满江红、
鳞木和
桫椤等。能入药的有：杉蔓石松能祛风湿，舒筋活血；节节草能治化脓性骨髓炎；乌蕨可治菌痢、急性肠炎，长柄石韦可治急、慢性肾炎、肾盂肾炎等；绵马鳞毛蕨和其许多近亲种可治牛羊的肝蛭病等。