厦门大学数学学科办学历史悠久，1923年成立算学系，是厦门大学最早设立的系之一。2003年成立数学科学学院。

截止2021年3月，学院现有数学与应用数学系、信息与计算数学系、概率与数理统计系3个系，开设数学与应用数学、信息与计算科学和统计学3个本科专业。

国家级一流本科专业建设点：数学与应用数学、信息与计算科学、统计学

截止2023年2月，学院有专任教师94人，其中教授44人，副教授32人，博士生导师39人。国家级高层次人才3人，国务院学位委员会学科评议组成员1人，教育部教指委委员2人，国家级教学名师1人，国务院政府特殊津贴获得者5人，教育部新（跨）世纪优秀人才培养计划5人，国家级高层次青年人才13人，省校特聘教授11人，以及其他省市人才计划入选者63人次。

国家万人计划：林亚南

国务院政府特殊津贴专家：程立新、林亚南、许传炬、谭忠、谭绍滨

国家教学名师：林亚南

国务院学科评议组成员：谭绍滨（第六、七届）、谭忠（第八届）

国家高层次青年人才：陈黄鑫、黄文、刘文飞、毛志平、宋翀、王清、王焰金、夏超、熊涛、余世霖

教育部“新（跨）世纪优秀人才培养计划”：白正简、程立新、许传炬、钟春平、朱玉峻

闽江学者特聘教授：刘文飞、邱建贤、谭绍滨、谭忠、夏超、许传炬、余世霖

厦门大学陈景润数学特聘教授：程立新、林亚南

截止2021年3月，学院现有数学、统计学一级博士学位授予权和数学、统计学博士后流动站，涵盖基础数学、计算数学、概率论与数理统计、应用数学和运筹学与控制论五个二级学科博士点和硕士点，其中基础数学为国家重点学科，数学为福建省重点学科和厦门大学“211”“985”“双一流”重点建设学科。

截止2021年3月，学院设有国家天元数学东南中心、福建省数学建模与高性能科学计算重点实验室。

截止2021年3月，近十年，学院累计获得国家自然科学基金、省部级科研项目、厦门市科研项目及横向课题等250余项，其中重大重点项目10余项；获教育部高等学校科学研究成果二等奖1项、福建省自然科学奖二等奖5项；在国内外期刊发表学术论文2000余篇。主办学术期刊《Journal of Mathematical Study》，合办学术期刊《East Asian Journal on Applied Mathematics》。