厦门大学校徽是厦门大学使用的标志。校徽为双圆套圆形徽标，圆环上方为繁体字“厦门大学”，下方为拉丁语“厦门大学（UNIVERSITAS AMOIENSIS）”，中部为盾形和绶带。盾形上有三颗五角星图案，盾形中心为城及城门图案，绶带上的“止于至善”四字为建校初期校训。以“普蓝色”为主体颜色。

1921年，厦门大学校徽为陈嘉庚先生创办厦门大学时所确定，是中国最早的大学校徽里比较具有代表性的校徽。（有资料显示为当年6月或7月由厦大校长林文庆所设计）

约20世纪20年代，鲁迅先生曾在厦门大学任教，其后使用的校徽是鲁迅手笔的“厦门大学”校徽。

2000年11月1日，经厦门大学党政领导研究，决定重新使用建校初期的校徽，以体现厦门大学悠久的历史。

厦门大学校徽为双圆套圆形徽标，圆环上方为繁体字“厦门大学”，下方为拉丁语“厦门大学（UNIVERSITAS AMOIENSIS）”，中部为盾形和绶带。盾形上有三颗五角星图案，盾形中心为城及城门图案，绶带上的“止于至善”四字为建校初期校训。学校曾用英文名称Amoy University和The University of Amoy。

厦门大学校徽主体颜色为普蓝色（色值：C100-M80-Y10-K10）。

厦门大学校徽具有特定的内涵，徽标圆环上方为繁体字“厦门大学”，下方为拉丁语“厦门大学”；盾形上的三颗五角星图案代表中国传统哲学中的“三才”，即所谓天然中精神的、宇宙的、人类的三大元素；盾形中心的城及城门图案为厦门之标志（大厦之门），象征着广纳贤才、开放办学。校徽在设计上糅合了西方传统意义上的圆形和盾形两种校徽的形状，并且搀合了国内传统文化的设计元素，其设计样式体现了厦门大学地处东南海滨、海峡西岸的地域特征及从容、淡定、包容和开放的独特气质，象征着厦大“爱国、革命、自强、科学”的四种精神。校徽的颜色体现了厦门大学的办学历史和文化积淀，也符合学校的气质和特色。

标志及中、英文标准组合：规范标志，中、英文标准组合大小比例，标出标志与字体所有比例关系，使字体建立于标准比例数据和标准落格上，完善其设计的准确性。用标准落格的方法标志组合在实际运用中更为方便。

2016年6月，学校使用“新版”学位证书、毕业证书，学位、毕业证书内页将厦大核心文化元素与中国传统文化元素融合在一起，充分体现了厦大的历史底蕴和中国文化传承。证书右下方使用校长的篆刻印鉴，庄重典雅；而学位证书左下方校徽采用凹凸印金工艺，大气美观。

2011年2月，厦门大学90年校庆标识确定，标志以“凤凰花开九十年”为主题，以“厦门大学校徽”、数字“90”（九十周年）、“盛开的凤凰花”、“1921-2011”为基本元素进行整合设计，标志将“90”与厦门大学校花“凤凰花”通过替代同构的方式进行构成组合，又将数字“90”本身正负形的关系与“厦门大学”的校徽进行组合设计，标志的色彩选择以凤凰花红橙相间的色彩为基调，传达和渲染了90周年校庆的氛围。

2021年4月6日，中国邮政发行《厦门大学建校一百周年》纪念邮票一套1枚，邮票面值为1.20元。该套邮票由设计师史渊设计，采用电脑手绘表现方式，以厦门大学的标志性建筑之一——群贤楼群为主体，同时表现了校徽、建南大会堂及海浪等元素，采用菱形设计，展现厦门大学深厚的历史底蕴、蓬勃的时代气息和浓郁的地域特色。

林文庆（1869—1957年），字梦琴。福建海澄（今龙海）人，出生于新加坡。清光绪十三年（1887年），考取奖学金，赴英国爱丁堡大学攻读医科,获硕士学位。光绪二十三年（1897年）创办《海峡华人杂志》。光绪二十五年（1899年）创办新加坡华人女学，并发起组织星洲中华会馆、海峡殖民地英籍华人协会、华人体育会等，致力于传播中国文化及华人教育事业。