厦门大学附属中山医院（以下简称中山医院）始建于1928年，由爱国华侨和地方知名人士为弘扬中山先生“天下为公，造福社会”的精神捐资兴建而成，时任厦门大学校长、医学专家林文庆博士出任首任院长。随着厦门经济特区发展，中山医院迁址重建，于1988年7月1日复办开诊。2005年，中山医院成为厦门大学首家附属医院，现已发展成为集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级甲等综合性医院和世界知名高水平研究型大学附属医院。目前拥有4个院区（院本部、金榜分部、厦禾分部、东部分院[在建]）。
中山医院总部占地面积约5.7万平方米；金榜分部占地面积约2600平方米；厦禾分部占地面积约1548平方米；在建的东部分院占地面积约9.7万平方米。医院现有编制床位3500张（其中在建1000张），拥有教职员工3000余人，其中副高以上专家近750名、硕士及博士850名、硕士生导师和博士生导师108名，承担厦门大学医学院、福建医科大学、厦门医学院等多所医学院校临床专业课程教学工作，也是厦门大学、福建医科大学博士硕士研究生培养单位。
2022年7月，由广州艾力彼医院管理研究中心主办的2022中国医院竞争力大会在厦举行，主办方现场公布了“2021中国医院竞争力排行榜”系列榜单。其中，在最具关注度的全国顶级医院100强榜单中，厦门大学附属中山医院排名第98位，首次上榜顶级医院百强榜单。
福建省临床重点专科：消化内科、肝胆胰外科、大普外科（胃肠外科、普外科、血管外科、乳腺外科、小儿外科、肝胆胰外科）、
肾内科、康复医学科、皮肤科、中医科、神经内科、骨科（关节外科与运动医学科、脊柱外科、创伤骨科、手足与显微外科）、重症医学科、呼吸与危重症医学科、医学检验科、临床护理。
国家级和市级医学中心：国家高级卒中中心、厦门市
临床检验中心、厦门市消化疾病诊治中心、厦门市卒中质控中心、厦门市脑血管疾病临床医学研究中心。
医学研究所：厦门市老年疾病康复研究所、
厦门大学消化疾病研究所、
厦门大学医学院胃肠道
肿瘤研究所、
厦门大学医学院微生态研究院、厦门大学医学院传染病研究所、厦门大学医学院
医学影像研究所、厦门大学医学院嗓音医学研究所、厦门大学医学院
骨关节病研究所。
省市重点实验室/科研平台：福建省
慢性肝病肝癌重点实验室、厦门市肝胆胰肿瘤转化医学重点实验室、厦门市胃肠肿瘤重点实验室、厦门市临床检验重点实验室、厦门市
肠道微生态与健康重点实验室、厦门市核医学
分子影像临床转化重点实验室、厦门市
肿瘤分子诊断与靶向治疗重大科技平台、国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心福建临床创新技术研发基地。
国家级和省级培训中心/基地：国家首批普通外科
专科医师规范化培训基地、国家住院医师规培基地、中华医学会消化内镜培训中心厦门培训基地、
中国医师协会腹腔镜外科医师培训基地、中国医师协会消化内镜医师培训基地、卫生部临床药师培训基地、全国
健康管理示范基地、中华医学会消化内镜培训中心、中国医师协会
神经内镜培训中心、福建省超声医学培训基地。