厦门市少年儿童图书馆始建于1986年元旦，是福建省首家独立建制的少年儿童图书馆，是中国数字图书馆厦门少儿分馆，首批“福建省小公民道德建设示范点”。原位于思明北路130号的四层楼馆舍系已故爱国人士郑忠益先生捐赠，因厦禾路旧城改造的需要，于2001年初迁往后埭溪路140号的新馆舍。同年6月1日正式对外开放。

该馆曾获两届全国“文明图书馆”、文化部“精神文明建设服务表彰单位”、全国“文化工作先进单位”及五届全国“红读活动先进集体”等荣誉称号。

1990年4月以来连续五届获市级“文明单位”称号。

2023年12月18日，被文化和旅游部评定为一级图书馆。

新馆馆舍面积5031平方米，辟有办证大厅、电子阅览室、声像服务室、低幼儿童阅览室、中小学生阅览室、音像资料室、教育参考阅览室、英文图书阅览室、少儿心理咨询室、自修室、集体外借书库、活动教室和多功能厅等服务窗口。现有馆藏文献30多万册（件）、电子图书4万多册、视频资料6000多部。各项业务工作均采用国家标准实行规范化管理，业务工作流程全部实行自动化管理。

我馆长期坚持开展特色服务，并形成品牌。馆外流通服务坚持“走向社会、主动服务，把图书馆办到少年儿童中去”的社会化办馆思想，长期致力于构建儿童图书馆服务网络，通过汽车图书馆、开办电脑联网分馆、集体用户等形式把各种服务辐射到厦门岛内外，常年为分布于厦门岛内外的集体外借用户、分馆流通站送书。自1989年“红领巾读书读报奖章”活动组委会办公室在我馆设立以来，建立起三级活动网络，每年组织1～2个全市性少儿读书活动，活动覆盖率达100%，成为我馆读书活动的一个特色品牌。2004年我馆与美国明德图书馆基金会创办了中国大陆首间原版英文图书阅览室，改写了我省没有少儿英文图书阅览室的历史，为我市少年儿童学习英语、增长见识、开阔视野创造了良好的条件。