发光器（官），photogenicorgan，是多数发光动物所具备的构造。多数深海生物具有，有照明，掠食，隐匿，信息交流等作用。

如海仙人掌和燐沙蚕，发光细胞分布于整个体表，与单细胞动物（如夜光虫等）和发光植物同样都缺乏特殊的发光器（不过夜光虫的脂质性发光颗粒称为发光细胞器）。另外发光部位属于局部的，在体外发光型中，发光装置多限于单细胞性和小形的发光腺或多细胞性的发光腺。在体内发光型中，也有具备各种辅助装置的。萤虫的发光器，系由颗粒性的发光细胞层及其背部的富有尿酸盐结晶的反射细胞层（reflecting cell）（亦称反射器reflector）所组成。所有这些都是中胚层性的，来源于脂肪体。发光器前面的角质膜缺乏色素而透明化，能使光很好地透过。在发光细胞层中，含有气管细支和神经纤维，供给发光中不可缺少的氧及传递诱发光反应所必需的神经冲动。在樱虾、萤乌贼以及发光性深海鱼类裸鳁、狗母鱼等，多数是表皮性的，但具有同样构造的发光器，并在前面有角质性水晶体层，背面有发达的色素层，颇似光感受器的眼睛。这样的发光器，在樱虾尾足上

左右具有1对，乌贼和鱼类分散在体表一侧。蓬莱箭鱼（Chauliodus emme－las）的一种，具有像虹彩器那样的发光装置，受神经的控制，由于它的开闭而产生发光效应。在发光鱼类中，除深海鱼以外，多属于细菌共生发光。与上述在外观上相似的发光器内，有发光细菌（在松球鱼的下颌发光器中有Vibrio monocentris）共生。也有的共生发光器在机体的深部而间接产生照明效应，乌贼类也存在共生发光。在深海鱼中如燐砗也有，通过虹彩肌的神经支配，来控制发光效应的；另一方面也有的没有神经分布，全靠激素进行支配。