口腔感染性疾病有急性和慢性感染之分，急性较重的口腔疾病必须在医师指导下合并处方药应用，以免延误病情。在治疗期间要注意休息，多饮水，戒除烟酒，不吃刺激性大或过咸过腻的食物，注意口腔卫生，饮食要以流食或半流食为主，避免食物对咽喉的刺激。国家非处方药中，口腔用药均为局部用药。
鹅口疮是由念珠菌属，大多是白色念珠菌所引起的口咽部真菌感染，多见于婴儿或长期应用广谱抗菌药物后，病变也可发生于扁桃体，喉部，食道，胃肠道，支气管，肺部，鼻腔，外耳道等处。口咽部真菌病的治疗主要用制菌素甘油溶液涂擦，亦可口服制菌素或酮康唑。
坏死性龈口炎由厌氧梭杆菌属及奋森螺旋体所引起，个人口腔卫生不良，机体抵抗力低下时可诱发本病。急性型者起病急骤，牙龈红肿流血，牙龈缘迅速坏死，口恶臭，颌下淋巴结肿痛。如患者抵抗力极度低下，病变可发展为坏疽性口炎，病死率较高。慢性型者多见于不注意口腔卫生的儿童。应全身应用抗生素，首选大剂量青霉素静脉注射，严重病例合用庞大霉素，亦可换用红霉素，克林霉素，头孢唑啉，交沙霉素等。局部外用1.5%过氧化氢（双氧水）0.02%氯已定溶液含漱或洗涤口腔，可同时服用复合维生素B，维生素C等。
牙槽脓肿多由感染牙髓坏死后，脓液引流不畅积聚在齿根端部而引起。病原菌为口腔寄殖菌群，主要为厌氧菌如消化球菌，消化链球菌，梭杆菌属，韦荣球菌属，类杆菌属及真杆菌属等，脓肿溃破后常有口腔需氧菌的混合感染。应采用青霉素或克林霉素肌注，也可用于红霉素，交沙霉素，
甲硝唑治疗。脓肿应予引流并除去坏死组织。
地喹氯铵、丁硼乳膏、复方氯己定达克罗宁、、 糠甾醇、氯己定苯佐卡因、浓替硝唑、西吡氯铵、 西地碘、樟脑苯酚、樟脑水合氯醛