台南第二高级中学，位于台湾省台南市北区，前身为日据时期“台湾总督府台南中学校”，是台湾历史最悠久的高级中学，简称为台南二中或南二中。过去仅招收男生，设有美术班男女兼收。
日本殖民政府为了方便在台受教，在台湾内设立了一连串的中学。1914年5月27日设立的台南二中，当时名称为“台湾总督府台南中学校”，与现
台北市立建国高级中学并列为台湾历史最悠久的高级中学。1922年配合州立台南二中（今台南一中）设立及中等学校交由各州管理政策，易籍“台南州立台南第一中学”，时教职员多隶日籍，台籍青年仅占十分之一而已。
台南二中在日据时期为五年制男子中学，战后遵行中华民国学制，改为三三制完全中学。1955年配合上级战时疏散决策，曾为台南一中、台南女中两校筹设联合分部于
台南县善化镇，男女兼收。翌年，改为省立善化高级中学。遂又独立设分部于台南县
永康市，专供初中学生疏散就读之用。1969年8月政府推行省办高中县市办初中政策，台南二中奉令专办高中，台南市立中学高中部三班学生转入本校肄业。永康分部初中十三班学生移交省立新营中学接办。
台南二中的学生在日本时代限收男学生，大部分为日本子弟，本省人仅有财有势之人可特准入学。战后，台南二中以男生为主，于1988年增设美术特别班，男女兼收，女生遂可报考就读。