台湾地区有温泉征兆的温泉区有128处，以温泉区地质来看，变质岩区最多，其次为火成岩区，沉积岩区最少。以化学特性分类，台湾温泉大多属于碳酸盐泉。经由放射性碳十四及氚定年，温泉年代大多已有一两万年之久，一两处最年轻的温泉也有几千年。

位于欧亚板块边缘的台湾，受到亿万来年东侧板块的推挤，在雪山山脉和中央山脉分布有广泛的变质岩区。雪山山脉和中央山脉西翼和部分东南翼属于低度变质岩的板岩区，中央山脉南翼属于中、高度变质岩的大南片岩区。台湾变质岩区的温泉多为中温温泉，温度约在50℃-74℃之间，此区的温泉也有介于75℃-96℃的高温温泉和温度高于97℃的沸腾温泉。

雪山山脉带：雪山山脉温泉区的变质砂岩和石英岩区的断层和褶皱，提供了温泉储存和涌出的孔道。此区共有20个温泉区和2个冷泉。分为是乌来温泉、新兴温泉(嘎拉贺温泉)、爷亨温泉、四棱温泉、秀峦温泉、小锦屏温泉、梵梵温泉、排骨溪温泉、谷关温泉、国姓温泉、惠荪温泉、红香温泉、瑞岩温泉、东埔温泉、乐乐谷温泉。

中央山脉板岩区：本区包含44个温泉和1个冷泉，多属于碳酸盐泉，分别为苏澳冷泉、乌帽温泉、清水温泉、土场温泉(天狗溪温泉)、鸠之泽温泉、庐山温泉、春阳温泉、太鲁湾温泉、精英温泉、奥万大温泉、万大南溪温泉、万大北溪温泉、丹大温泉、云山温泉、宝来温泉区(由上游至下游分别是十三坑温泉、十二坑温泉、十坑温泉、七坑温泉、石洞温泉、宝来温泉)、高中温泉、少年溪温泉、勤和温泉(玉穗温泉)、复兴温泉、不老温泉、梅山温泉、多纳温泉、寿梵温泉、大武温泉、四重溪温泉、旭海温泉、知本温泉、金峰温泉、比鲁温泉、都飞鲁温泉、近黄温泉、土坂温泉、普沙羽扬温泉、金仑温泉。

中央山脉大南澳片岩区：本区包含17个温泉和1个冷泉。碧侯温泉(五区温泉)、文山温泉、二子山温泉、瑞穗温泉、花莲红叶温泉、富源温泉、雾鹿温泉、摩刻南温泉、碧山温泉、辘辘温泉、彩霞温泉、栗松温泉、台东红叶温泉。

台湾火成岩区的温泉多为高温温泉，温度约在75℃-96℃之间，也有温度高于97℃的沸腾温泉。火成岩区的温泉只有较年轻的火山才有分布，台湾北部的火山岩区是由菲律宾海板块隐没入欧亚板块下所形成的火山岛弧，火山停止活动的时间约在近100万年。

大屯火山群:停止活动时间约20万年前。包括竹子山、大屯山、七星山、磺嘴山、湳子山-丁火朽山五个火山亚群。此区也是台湾温泉分布最密集的地区，包括北投温泉(地热谷)、硫磺谷温泉(大磺嘴温泉)、顶北投温泉、双重溪温泉、妈祖窟温泉、龙凤谷温泉、小隐潭温泉、湖山温泉、鼎笔桥温泉、中山楼温泉区、阳明山温泉(竹子湖温泉)、小油坑温泉区、后山温泉区、冷水坑温泉区、马槽温泉、七股温泉、大油坑温泉、八烟温泉、四磺坪温泉区、庚子坪温泉区、金山温泉、磺港温泉、加投温泉。

龟山岛:主要由安山岩构成，位于琉球火山岛弧西缘，最近一次火山喷发约是距今7000年前，属于活火山，其温泉属于高温酸性硫酸盐泉或硫酸盐氯化物泉。

绿岛:是吕宋火山岛弧北部延伸的一部分，温泉水质为酸性硫酸盐氯化物泉。温泉出露点在绿岛东南侧，面向日出方向，故名为朝日温泉，并由东部海岸风景管理处在此设立温泉公园。

台湾沉积岩区出露的温泉，由于地温梯度较低，裂隙不如变质岩地区深，静水压力较小，因此此区的温泉多为低温温泉甚至冷泉，温度约于25℃~49℃间。数量也是台湾三种主要岩区中最少的。

北部：金泉温泉、清泉温泉、北埔冷泉、新埔温泉

中部：泰安温泉群

南部：中仑温泉、关子岭温泉、龟丹温泉、六重溪温泉、大岗山温泉、四重溪温泉

海岸山脉：利吉温泉、富里温泉、安通温泉、东里一号温泉、东里二号温泉

兰阳平原：礁溪温泉、员山温泉

台湾温泉的开放利用，可分为清朝时代、台湾日据时期(1896年-1945年)、地热探勘时代(1962年-1995年)和温泉热时代(1990年-)四个时期。最早有记载台湾温泉的文献是清朝康熙36年（西元1697年）浙江仁和县诸生郁永河所著的裨海纪游，当中描述了大屯火山群，这同时也是台湾第一件具备温火山温泉地质的记述：

“石作览靛色，有沸泉，草色萎黄，无生意。山麓白气谣，是为磺穴。穴中毒烟喷人，触脑欲裂。”

台湾主要的温泉区都是在日据时期开发，由于温泉(泡汤)是位处高纬度日本人主要的文化之一，在统治台湾时期，积极开发各地的温泉，作为当地警察的疗养所。例如由警政单位管理的“警光山庄”，即承袭日据时期的相关设施。

在地热探勘时期，台湾温泉的发展主要以地质研究和发电发展为目的，主要参与的单位包括“美军顾问团”、台湾中国石油公司、台湾联合矿业研究所等，但在1966年-1974年的阳明山马槽温泉区的研究中，由于无法克服地热流体的强腐蚀性，而结束工作。1973年之后，在中央山脉的探勘过程中，在宜兰地区钻凿的井中，约450公尺，水温可达150-230度，生产量10-100吨/时，在1981年于清水建立地热试验发电场，最高发电量是2000千瓦，八年之后设备受到阻塞，发电量降至500千瓦，于1995年关闭。

台湾在1990年解严以后，受到各类媒体休闲娱乐旅游节目影响，许多温泉区纷纷引进日本温泉的经营模式，强调温泉的养生、健康、美容与休闲的功能，促使温泉旅游业快速发展。

由于台湾地属亚热带及热带，冬季以外其实并非浸泡温泉的好时机。尤其清代汉人虽早已发现温泉，但误以为温泉是一种有毒的水，不敢冒然接近，整个华南及台湾地区皆未有浸泡温泉的风俗。但是热爱泡汤文化的日本人，则视台湾温泉为珍宝，温泉文化主要亦在日据时期引进。

也由于多数时间并不是温泉旺季，故现代台湾温泉业者除了温泉外，尚提供养生、热疗、美容甚至宾馆的型态经营，甚至结合SPA与美食餐厅，或以渡假区方式经营，与日本温泉经营方向有极大不同。最明显的例子，日本温泉旅馆通常仅有大众池有温泉，且其余设施并不多；但台湾温泉常附设水疗等，房间也提供泉水供旅客休息使用。