《吉林大学学报（医学版）》是中华人民共和国教育部主管、吉林大学主办的综合性医药卫生类学术期刊。

1959年，《吉林医科大学学报》创刊。

1966年，《吉林医科大学学报》停刊。

1975年，《吉林医科大学学报》复刊。

1978年，随学校更名，《吉林医科大学学报》更名为《白求恩医科大学学报》。

1983年，刊期由季刊变更为双月刊。

2002年，《白求恩医科大学学报》更名为《吉林大学学报（医学版）》。

2014年12月，入选国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《吉林大学学报（医学版）》设有基础研究、临床研究、临床医学、影像学、调查研究、方法学和综述等栏目，以基础研究和临床研究论著为主，兼顾其他体裁的文章，综述类论文原则上以约稿为主。

据2019年2月该刊编辑部官网显示，《吉林大学学报（医学版）》编辑委员会有主任委员1名，副主任委员9名，委员53名，顾问委员7名，外籍委员3名，均为在医学科学研究领域取得研究成果的各学科专业的学术带头人，其中95%为博士研究生导师；《吉林大学学报（医学版）》编辑部有专职编辑5名（博士1名，硕士4名；编审3名，副编审1名，编辑1名）。

截至2019年6月，《吉林大学学报（医学版）》全年刊发约240篇文章，基金资助项目论文占90%以上，其中有国家重点科技攻关项目、国家863计划项目、973计划项目及国家自然科学基金项目。

据2019年2月22日中国知网显示，《吉林大学学报（医学版）》共出版文献15654篇。

据2019年2月22日万方数据知识服务平台显示，《吉林大学学报（医学版）》共载文6612篇，基金论文3161篇。

《吉林大学学报（医学版）》是CSCD中国科学引文数据库来源期刊（2017-2018年度）（含扩展版）、北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊（1992年（第一版）、1996年（第二版）、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版、2017年版）、中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊），被CA《化学文摘》（美）（2014）、荷兰《医学文摘（EM）》、荷兰《文摘与引文数据库（SCOPUS）》、英国《动物学记录（ZR）》、美国《剑桥科学文摘（CSA）》、WHO西太平洋地区医学索引（WPRIM），中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）、中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中国核心期刊（遴选）数据库、中国期刊网和中国学术期刊（光盘版）、中国科技论文在线、中国知网学术期刊优先数字出版平台、万方数据——数字化期刊群、超星期刊域出版平台、《中国学术期刊文摘》、中国生物医学期刊文献数据库、中国生物医学文献数据库和中国终身教育学术研究数据库等收录。

根据中国科学技术信息研究所2009年版《中国科技期刊引证报告（核心版）》收录的1868种中国科技论文统计源期刊的统计报告，2008年《吉林大学学报（医学版）》总被引频次为934、影响因子0.400、被引半衰期4.58（即年指标0.018）、他引率0.88、引用刊数33、扩散因子3.53、权威因子333.69、学科扩散指标0.67、学科影响指标0.57、文献选出率0.64、参考文献量2776、平均引文数9.91，在49种医科大学学报类期刊中总被引频次排第7名，影响因子排第9名。

据2019年2月22日中国知网显示，《吉林大学学报（医学版）》总被下载1125003次、总被引46662次、（2018版）复合影响因子为0.978、（2018版）综合影响因子为0.775。

据2019年2月22日万方数据知识服务平台显示，《吉林大学学报（医学版）》被引量为19161、下载量为102115；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）来源数据显示，该刊影响因子为0.90，在全部统计源期刊（6735种）中排第1245名，在大学学报（医药卫生）（114种）中排第38名。

《吉林大学学报（医学版）》立足于“尊重科学、鼓励创新、弘扬学术、追求卓越”的办刊理念，坚持“遵循中国共产党和中国国家的办刊政策及法规，报道医学科学研究新理论、新方法和新技术，促进医学科学发展和中国国内外学术交流”的办刊宗旨，以提高刊物的学术质量和编辑质量为发展目标。