化工与应用化学系是2000年由原
吉林大学、
吉林工业大学、
长春科技大学的
化学工程与工艺和应用化学两个专业整合而成。具有工科应用化学硕士和应用化学博士学位授予权。现有教师20人，其中教授10人，博士生导师7人。
应用化学学科建设中一直是以应用基础研究和应用为目标，以社会需求为导向，理工结合，以培养具有完善的知识结构、扎实的专业基础知识和一定的专业技术能力以及科研、创新能力，综合素质好，德智体全面发展的复合型人才为特色。现已培养硕士生 300多名，全日制博士生50多名。
方向一
涂料设计、制备与计算机模拟该方向主要从保护环境、社会可持续发展角度探索既有良好性能和功能，又与环境协调较好的环境友好型涂料。研究涂料制备及成膜过程的多尺度效应，结合计算机模拟对涂层的部分力学性能和涂层组分进行设计；对乳液聚合过程进行计算机模拟；对有机/无机
杂化材料合成过程中溶胶形成的原子模拟；对涂料性能进行预测，达到在一定理论指导下进行涂料配方设计，加速新涂料的筛选和开发，并以此提高涂料研究的科学性和目的性。
方向二光电磁功能材料该方向的研究领域主要包括无机功能材料、稀土光电磁功能材料及应用、纳米材料与有机/
无机复合材料化学等。在材料的分离、合成、表征与结构等基础研究方面进行深入的探讨。利用溶胶一凝胶法和高温固相方法制备了掺入
稀土元素的M型、w型、Z型六方铁氧体，新合成的稀土铁氧体具有重要的学术和应用价值。在研究稀土
光电材料与稀土
吸波材料的理论基础，新型稀土
荧光材料、稀土铁氧体吸波材料等方面已取得了很大进展。
化工与应用化学系已初步形成了老中青相结合的教学梯队和以博士生导师为学术带头人，中青年教师为骨干的学术队伍。先后承担多项国家863项目、973项目、
国家自然科学基金项目和40多项省部级项目，还有10余项企业联合项目。获省部级教学和科研奖励8项，编写统编教材8部。近几年被SCI和EI收录的论文172篇 ，论文被他人引用310次。申请专利30余项，其中获授权专利7项，转让专利3项。
应用化学学科积极开展国际交流与合作，与德国马普胶体与界面研究所和俄罗斯
托木斯克理工大学进行合作研究，并多次参加美国、澳大利亚等国外的国际学术会议进行学术交流。