吉林市人民政府是由吉林省人民政府直接领导的地市级权力机构的执行部门，对市人大及其常务委员会，同时对省政府负责并报告工作。

1968年3月，成立吉林市革命委员会。

1980年撤消吉林市革命委员会，改称吉林市人民政府。

1945年10月，在中共吉林市委组织下成立吉林市政府；

1945年11月在吉林市成立吉林省政府。

1946年5月，吉林省、市政府撤出吉林市。同年10月，在吉林市成立吉林省、市政府。

1948年3月9日，吉林市解放。同年10月，吉林省政府从延吉市迁回吉林市。

1948年10月23日，成立吉林市人民政府。

1949年中华人民共和国成立后，吉林省、市政府仍设在吉林市。

1954年9月，吉林省政府迁往长春市。

吉林市人民政府办公室

吉林市发展和改革委员会

吉林市教育局

吉林市科学技术局

吉林市工业和信息化局

吉林市民族事务委员会（吉林市宗教事务局）

吉林市公安局

吉林市民政局

吉林市司法局

吉林市财政局

吉林市人力资源和社会保障局

吉林市规划和自然资源局

吉林市生态环境局

吉林市住房和城乡建设局

吉林市城市管理行政执法局

吉林市交通运输局

吉林市水利局

吉林市农业农村局

吉林市商务局

吉林市人民政府合作交流办公室

吉林市文化广播和电视旅游局

吉林市卫生健康委员会

吉林市退役军人事务局

吉林市应急管理局

吉林市审计局

吉林市人民政府外事办公室

吉林市市场监管局

吉林市人民政府国有资产监督管理委员会

吉林市体育局

吉林市医疗保障局

吉林市机关事务管理局

吉林市人民防空办公室

吉林市金融工作办公室

吉林市政务服务和数字化建设管理局

吉林市扶贫开发办公室

吉林市林业局

截止2006年，市区总面积3636平方公里；城市规划区面积1995平方公里；建成区面积231平方公里。辖4区（昌邑区、船营区、龙潭区、丰满区）、5县市（永吉县、舒兰市、磐石市、蛟河市、桦甸市）、78个乡镇、71个街道办事处，1个国家级高新技术产业开发区和1个国家级经济技术开发区。

2021年6月25日，吉林市人民政府森林防灭火指挥部办公室被公示为“吉林省连续40年无重大森林火灾先进集体拟表彰对象”。

市委副书记、市长：王吉

市委常委、常务副市长：武忠旭

副市长：王石红、刘立新、丁相明、刘向涛、刘大蔚、陈洪治、付彦平、隗楠