《同济大学学报（医学版）》创刊于1980年，是由中华人民共和国教育部主管、同济大学主办的医学类学术期刊。

1980年，《上海铁道医学院学报》创刊。

1996年，《上海铁道医学院学报》更名为《上海铁道医学院学报（医学版）》。

2001年，《上海铁道医学院学报（医学版）》更名为《同济大学学报（医学版）》。

2009年1月，该刊开通网上投稿系统，同时取消了纸版邮寄投稿。

2014年12月，该刊成为中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《同济大学学报（医学版）》主要栏目有基础研究、临床研究、调查研究及综述等。

据2020年3月《同济大学学报（医学版）》官网显示，《同济大学学报（医学版）》第九届编委会有编委79人。

据2020年3月15日中国知网显示，《同济大学学报（医学版）》共出版文献3802篇。

据2020年3月15日万方数据知识服务平台显示，《同济大学学报（医学版）》共载文4369篇、基金论文量为1390篇。

《同济大学学报（医学版）》是CA化学文摘（美）（2014）来源期刊、中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊），被中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）、中国学术期刊网络出版总库（中国知网）、中国核心期刊（遴选）数据库（万方）、中国生物医学文献光盘数据库（CBMdisc）、中文生物医学期刊文献收据库（CMCC）、中文科技期刊数据库（维普）、中国学术期刊评价研究报告（RCCSE）核心期刊、超星学术期刊“域出版”平台收录。

据2020年3月15日中国知网显示，《同济大学学报（医学版）》总被下载415608次、总被引17395次，（2019版）复合影响因子为0.772、（2019版）综合影响因子为0.705。

据2020年3月15日万方数据知识服务平台显示，《同济大学学报（医学版）》被引量为19048次、下载量为158754次；据2017年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊影响因子为0.61（医药大学学报刊均影响因子为1.0），在全部统计源期刊（6670种）中排第2830名。

《同济大学学报（医学版）》曾获得首届《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范》执行优秀奖。

2004年，在全国高校优秀科技期刊评比中获得优秀编辑出版质量奖。

2011年，获得上海市期刊优秀编校质量奖。

2013年，获得上海市高校科技期刊优秀编辑奖。

2014年，获得华东地区高等院校自然科学学报编辑协会优秀论文二等奖。

2018年5月，获得第三届上海市高校优秀科技期刊奖；同年11月，获得中国高校优秀科技期刊。

1、文稿应具有科学性、逻辑性、创新性和实用性，论文内容真实，数据准确可靠，论点鲜明，结论明确，文字简洁，逻辑合理，层次清楚，图表表达规范，论著稿全文字数不超过6000字为宜（包括中英文摘要、图表、参考文献），使用规范汉字及词语。

2、投稿须提供作者所在单位或导师审核并开具介绍信，介绍信应证明论文属于原创、无一稿多投、无署名争议、不涉及保密等，介绍信可通过邮局寄至该刊编辑部或扫描后上传至投稿系统，投稿文责一律由作者自负，该刊编辑部有权对投稿进行必要的删改。

3、文题应简明、准确，有专指性，并含有足够的信息，投稿均须附有中英文标题，中文题名一般不超过20个汉字，一般不设副标题，英文题名应与中文题名含义一致，以短语为主要形式，尤以名词短语（noun phrase）为主。

4、作者署名以6名为限，署名排序应在投稿时确定，全部作者的姓名（包括汉语拼音姓名）均应列出，作者人名拼写：姓前名后，姓大写，名首字母大写，作者单位和科室需写全称，并注明所在地和邮政编码。

5、摘要，基础研究和临床研究需附中、英文摘要，内容要一致，摘要应简洁、明了，书写采用结构式，包括目的（objective）、方法（methods）、结果（results）和结论（conclusion）4部分内容，专家笔谈、综述文章的中英文摘要书写为指示性摘要，重点在目的和成果，以50～100字为宜。

6、关键词尽量从当年版MeSH词表（医学主题词注释字顺表）中选择，一般3～8个，MeSH词表中无该词时，方可用习用的自由词，中英文关键词要一一对应，分别置中英文摘要下方。

7、正文包括4方面内容，即引言、材料与方法、结果、讨论。

8、引言一般不超过250个字，阐明研究目的、中国国内外研究现状等，引言部分可引用少量参考文献，不必详细讨论，以免与讨论部分重复。