进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。在进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的
相似性，但其功能不一定相同。
同源性（homology）是指在分子进化研究中，同源性一般是指两种核酸分子的
核苷酸序列之间或两种蛋白质分子的氨基酸序列之间的相似程度。序列分析是最终测定同源性程度的方法，DNA—DNA杂交或DNA—RNA杂交也是有用的估计途径。
同源性是比较生物学中的一个中心概念。同源，最基本的意义就是具有共同祖先。一般来说，如果两个物种中有两个性状（状态）满足以下两个条件中的任意一个，就可以称这两个性状为一对同源性状：
由于进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的
相似性，但其功能不一定相同，如狗的前肢和鸟的翅。从分子水平讲则是指两个核酸分子的
核苷酸序列或两个蛋白质分子的
氨基酸序列间的相似程度。虽然同源性须通过
序列测定来检验，但是DNA-DNA或DNA-RNA杂交可提供有价值的估计。