后南朝（ごなんちょう）是日本历史上对1392年南北朝统一后试图复辟南朝皇统的一系列政权及皇室的统称。这一称谓由江户时代末期的儒学者斋藤拙堂所创，在此之前没有特定名称，而且在战后才广为使用。

在1392年南北朝统一的约定《明德和约》中，规定了天皇皇位由北朝（持明院统）和南朝（大觉寺统）交替传承，是为两统迭立。但是以1412年后小松天皇让位于其子称光天皇为契机，对北朝垄断皇位的反抗就拉开了序幕。

1414年，伊势国司北畠满雅起兵，支持在四年前逃离京都出走吉野的南朝末代天皇后龟山天皇及其皇子小仓宫恒敦，在遭到室町幕府的讨伐后和解，后龟山天皇在二年后归京。

后龟山天皇死后4年，即1428年，称光天皇无嗣而崩，北朝嫡统断绝，时为上皇的后小松天皇又将伏见宫家的彦仁王（但他是持明院统本来的嫡统）选为后继者，是为后花园天皇。以此为契机，认定北朝皇统断绝的南朝方面激烈反抗。北畠满雅再次扶植小仓宫圣承（小仓宫恒敦之子）在伊势起兵，与幕府军交战并败死。

从这个事件开始到应仁之乱，南朝子孙被反幕势力扶植，不时展开活动。1443年9月发生了震惊日本的禁阙之变，一心复兴南朝的日野家嫡统日野有光等的势力企图暗杀后花园天皇而闯入御所（暗杀未遂），夺走了三种神器中的剑和神玺，拥戴南朝皇族通藏主、金藏主兄弟（后龟山天皇弟弟的孙子）逃往比叡山。幕府在数日内镇压了变乱，并将通藏主、金藏、日野有光等主谋全部杀死。

幕府虽然讨平了首谋者，夺回了剑，但神玺还在后南朝的手中。到了1457年，想要复兴在嘉吉之乱中没落的赤松氏的赤松氏遗臣上月满吉、石见太郎、丹生屋带刀假托“臣从”而偷袭了以大和、纪伊国境附近的北山（今奈良县吉野郡上北山村，一说在三之公即同郡川上村）为根据地的后南朝势力，杀死了南朝后裔自天王（尊秀王）、忠义王兄弟，夺走了神玺，史称“长禄之变”。迄今为止，北山地方的百姓每年都要举行一次”朝拜”两位王子遗物甲胄的仪式，借以抒发对后南朝的怀念之情。

后南朝势力在室町幕府的打击下逐渐消亡，但在1471年应仁之乱中，号称小仓宫后裔的冈崎前门主之子被山名宗全等西军大名迎入洛中的西阵，史称“西阵南帝”。但随着1473年3月西军大将宗全战死、东西两军走向议和、同时足利义视也不乐见其拥立，这个南朝后裔便被西军抛弃了。“西阵南帝”之后，后南朝便退出了历史舞台。

但是，在《后心深院关白记》中记载了长庆天皇的后裔八寿王在信贵山建立了昭怀南朝的“落人传说”，但无法确定；此外有说法是南朝后裔在美作建立美作后南朝、被称为“植月御所”，这也不能确定。然而，泷川政次郎指出，此后在民间流传着后南朝的传说或传承，很可能是作为一种“贵种流离谈”而被山民利用。

在太平洋战争后的开放氛围中，出现了自称“西阵南帝”子孙的“熊泽天皇”（熊泽宽道）等形形色色的声称自己为正统天皇继承者的自称天皇，他们大多秉持1911年明治天皇裁断的南朝正统、主张自己是后南朝的子孙。