吐鲁番直隶厅是清代机构。

地处新疆省东部。吐鲁番，维语意为富庶丰饶的地方。清圣祖康熙19年(1680年)，准噶尔部控制吐鲁番盆地；高宗乾隆20年(1755年)属清，24年(1759年)，设辟展办事大臣及同知，隶甘肃布政司；穆宗同治9年(1870年)，阿古柏占领吐鲁番，德宗光绪3年(1877年)，收复；12年(1886年)，设吐鲁番直隶厅，隶镇迪道。厅治吐鲁番（今新疆维吾尔自治区吐鲁番市）。