该行政区域已有所调整。根据《江苏省人民政府关于调整淮安市淮安区淮阴区盱眙县金湖县部分行政区划的批复》显示：撤销
码头镇、吴城镇、
凌桥乡，设立
马头镇。
淮阴区辖镇。位于区境西南部，废黄河南岸，距城区约35千米，距洪泽湖约10千米。东邻南陈集镇、码头镇，南接韩桥乡，西连泗阳县新袁镇，北与凌桥乡隔京杭大运河相望。面积53.75平方千米，人口32894人（2017年）。辖1个居委会和9个行政村。
1957年为吴集乡，1958年改公社，1983年更名南吴集乡。1996年，面积50平方千米，人口3.1万人，辖南吴集、南圩、更生、淮泗、集西、堡工、黄河、河滩、头庄、二庄、运河、联泗、陶庄、小河北、果林场、农科站16个行政村。2007年辖吴城、城南、城西、淮泗、堡工、黄河、河滩、头庄、利民、三园10个行政村，72个村民小组。
【2011年代码及城乡分类】320804102：～001 121吴城居委会 ～201 220城南村 ～202 122城西村 ～203 220淮泗村 ～204 122堡工村 ～205 220黄河村 ～206 220河滩村 ～207 220头庄村 ～208 220利民村 ～209 220三园村
【2007年村民小组、人口数据】吴城村： 10组1142户4979人。城南村：11组1031户4453人。城西村： 6组 614户2716人。淮泗村： 6组 468户2153人。堡工村： 6组 497户2378人。黄河村： 5组 468户2266人。河滩村： 6组 724户3118人。头庄村： 5组 810户2974人。利民村： 9组 860户3818人。 三园村： 8组 874户3857人。
吴城镇位于
江苏省
淮安市
淮阴区西南部，邮编223342，距城区约35公里，东与南陈集、
码头镇相连，南与
韩桥乡接壤，距
洪泽湖约10公里，西与
宿迁市泗阳县交界，北傍京杭大运河，与
凌桥乡隔河相望。