组织实施吴川市卫生行政部门制定的卫生监督计划，依照卫生法律法规行使预防性和经常性卫生监督职能。
吴川市卫生监督所主要职能有：
二、执行卫生行政部门委托承担对公共卫生、职业卫生、医疗卫生机构的监督；
三、受理卫生许可证和执业许可证的申请以及健康卫生产品、医疗广告内容的审核；
四、承担对卫生行政处罚案件的调查取证、提出处罚建议、执行处罚决定；
五、参与对危害公共卫生中毒事故、医疗事故、重大疫情和突发事件的调查处理。
吴川市卫生监督所科室设置有：办公室、医疗机构监督股、食品卫生监督股、职业卫生监督股、公共卫生监督股、卫生许可认证、卫生场地预审共7个室。