吴昊恩出生于台湾省台东县南王部落，他从小在教堂圣诗班里长大，由于受到教会音乐和西方音乐的影响，让他从小就热爱音乐。吴昊恩与陈建年、胡德夫来自同一个村落，他14岁开始弹蓝调吉他，17岁便到台北打拼追梦，远离了故乡台东的高山、海洋，城市并没有给吴昊恩的音乐创作带来太多的灵感。1997年，20岁出头他加入了一个致力于采集、传承原住民乐舞的艺术团体“原舞者”，那时候团员们一有时间就要到部落中去向耆老讨教，吴昊恩也借此得以有机会回到自己的部落，去了解一直被他忽略没有理解的部落文化，向村里的老人学习古调。
2005年，凭借创作曲《蜥蜴》获得台湾原创音乐大奖原住民组首奖。2006年，吴昊恩与外甥女
家家组成“
昊恩家家”组合；12月26日，随昊恩家家推出组合首张音乐专辑《
Blue in Love》，收录了包括《星星数不清》《我好想你》等在内的12首歌曲，从而正式进入演艺圈。
2007年6月16日，随昊恩家家获得第18届台湾金曲奖最佳演唱组合奖；10月，参加中天综合台谈话类节目《
康熙来了》；此外，他还发行了原住民语单曲《大巴塱之歌》《要记得说再见》，收录于合辑《
美丽心民谣》中。
2008年7月，与
张震岳、
范逸臣、
罗美玲等一同举办“山地之夜”原住民音乐会；之后，昊恩家家宣布解散， 吴昊恩则以个人形式继续发展。2011年，参演由龙男·以撒克·凡亚思执导的音乐电影《
很久沒有敬我了你》上映。2012年，其演唱的歌曲《成年的呼唤》发布，收录于Daniel Ho的专辑《吹过岛屿的风》中。2013年，参加歌唱节目《
超级歌喉赞》PK战；10月31日，推出个人单曲《泥巴的眼泪》，收录于合辑《天空的眼睛》中。
2015年7月4日，作为表演嘉宾参加首届国际游牧音乐节；7月30日，与乌克丽丽演奏者
Daniel Ho合作推出 原住民语专辑《
洄游》，收录了包括《请为我开门》《马当姑娘》等在内的12首歌曲，该专辑获得第27届台湾金曲奖最佳原住民专辑奖。2016年5月，作为表演嘉宾参加“降噪IV摇滚·民谣系列音乐会”。
2019年10月22日，作为表演嘉宾参加“胡德夫——山谷的呼唤演唱会”上海站；与此同时，他还担任了“台東豐采有聲有色—semenaya ta族語歌曲編作與製作計畫”的音樂統籌。
吴昊恩与陆森宝、陈建年、家家、纪晓君源自同一个家族，他从小就展露了音乐天份，因二表哥曾明辉的启蒙而开始吉他自学之路。2004年3月，吴昊恩的父亲确诊为肝癌，并于父亲节前一天病逝，之后吴昊恩为纪念与父母的一段故事而创作了 歌曲《成为你们的依靠》。
吴昊恩的音乐不仅具有中国台湾本土音乐之代表性，亦具国际竞争发展潜力。他的歌声浑厚而细致，爆发力惊人却收放自如。他的创作单纯直率，没有空泛的词藻堆叠，没有夸张的情感耽溺，每一首创作都有它的真实故事，支撑歌曲想传达的安慰，不带负担地温暖每个灵魂。作为台东海岸的原住民歌手，他纯朴自然的歌声真挚动人中，又不缺乏与时代同步的自我创新。吴昊恩对于大山里声音的自觉整理，足以令人凝神聆。他与家家以男女演唱组合的形式，让大家听到了不一样的原住民音乐，而《Blue in love》是昊恩家家的首张创作专辑，他们利用吉他创作演唱，唱出了蓝调爵士乐、灵魂乐等不同于华语乐坛主流的乐风，也让大家听到原住民歌手也可以唱出不一样的乐风（腾讯、银河网络电台、《南方都市报》、新浪评）。