吴耘（？～1944），原名吴金堂，抗日烈士。山东平原人。

吴耘1934年考入济南省立第一师范学校，在校期间，积极参加抗日救国活动。毕业后，先后考入“乡村人员培训班”、山西运城民族革命大学、八路军陕北公学学习，并在陕北公学加入中国共产党，担任中队党支部委员。1938年10月，由陕北公学分配到八路军西安办事处工作。1940年调中共山东分局任职工科科长兼党总支书记。1942年后，先后任山东军区滨海独立旅政治部副主任，滨海支队组织科科长，滨海支队二十五团政委，滨海支队政治部主任。

“讨李（永平）战役”后期，为巩固胶东和滨海两大战略区的联系，滨海支队奉命在诸胶边地区（现胶南市辖域）坚持斗争。1944年10月，日军一个大队约500余人，率伪滨海地区警备军李永平部、伪联队长相铭忱部分南北两路合击八路军滨海支队。吴耘率一排兵力在胶南县市美乡耿家沟北岭阻击敌人，掩护主力部队突围。吴耘与18名指战员顽强战斗，拼死阻击，最后终因敌众我寡，全部壮烈牺牲。滨海支队主力突围后，东进敌占区打击敌伪政权，迫使敌人仓皇撤退，取得反“扫荡”胜利。